44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1167 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1695  hypothetical protein  85.92 
 
 		 409 aa  680    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1167  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  806    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.367951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1661  manganese transporter NRAMP  85.92 
 
 		 409 aa  680    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3381  manganese transporter NRAMP  52.54 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.764333 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1443  putative transmembrane transport protein  52.64 
 
 		 413 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0028  permease (transport protein)  51.79 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1097  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  50.52 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2227  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  50 
 
 		 394 aa  362  7.0000000000000005e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19210  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  48.61 
 
 		 427 aa  354  1e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0711  transmembrane transport protein  50.13 
 
 		 406 aa  352  8.999999999999999e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119432  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3559  hypothetical protein  47.33 
 
 		 416 aa  349  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4281  putative transmembrane transport protein  50.52 
 
 		 386 aa  348  9e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2199  Mn2+/Fe2- transporter, NRAMP family  46.87 
 
 		 414 aa  341  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5193  hypothetical protein  47.8 
 
 		 412 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.249883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00410  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  45.3 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0496  hypothetical protein  45.76 
 
 		 410 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5377  hypothetical protein  46.53 
 
 		 410 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31598  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0987  manganese transporter NRAMP  46.11 
 
 		 410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0438146  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000480  hypothetical protein  43.47 
 
 		 412 aa  311  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5852  hypothetical protein  42.82 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0575384  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3271  manganese transporter NRAMP  42.47 
 
 		 412 aa  296  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0536  hypothetical protein  47.04 
 
 		 421 aa  293  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131848  decreased coverage  0.00419582 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0319  hypothetical protein  50.44 
 
 		 411 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  27.34 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  24.13 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  25.71 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  24.32 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  24.26 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  25.73 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.62 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  23.91 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  23.8 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  22.81 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  24.94 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0733  natural resistance-associated macrophage protein  26.84 
 
 		 422 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  25.19 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  19.47 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  22.56 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  21.56 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  21.94 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  22.22 
 
 		 463 aa  43.9  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  23.39 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  20 
 
 		 427 aa  43.5  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>