33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0711 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0711  transmembrane transport protein  100 
 
 
406 aa  790    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119432  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0028  permease (transport protein)  53.93 
 
 
395 aa  420  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1443  putative transmembrane transport protein  52.27 
 
 
413 aa  415  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1097  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  48.17 
 
 
395 aa  393  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4281  putative transmembrane transport protein  55.56 
 
 
386 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2227  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  51.36 
 
 
394 aa  377  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19210  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  54.35 
 
 
427 aa  361  1e-98  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3381  manganese transporter NRAMP  45.9 
 
 
408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.764333 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1661  manganese transporter NRAMP  50 
 
 
409 aa  352  5e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1695  hypothetical protein  50 
 
 
409 aa  352  5e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2199  Mn2+/Fe2- transporter, NRAMP family  50.38 
 
 
414 aa  347  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3559  hypothetical protein  47.78 
 
 
416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0987  manganese transporter NRAMP  45.28 
 
 
410 aa  340  2.9999999999999998e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0438146  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1167  hypothetical protein  50.13 
 
 
414 aa  335  7.999999999999999e-91  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.367951  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00410  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  49.23 
 
 
426 aa  334  2e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5193  hypothetical protein  49.34 
 
 
412 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.249883  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000480  hypothetical protein  46.23 
 
 
412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0496  hypothetical protein  46.39 
 
 
410 aa  323  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5852  hypothetical protein  44.78 
 
 
425 aa  322  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0575384  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5377  hypothetical protein  45.19 
 
 
410 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0319  hypothetical protein  45.61 
 
 
411 aa  319  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3271  manganese transporter NRAMP  44.04 
 
 
412 aa  319  5e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0536  hypothetical protein  44.56 
 
 
421 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131848  decreased coverage  0.00419582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  24.29 
 
 
398 aa  57.4  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  23.65 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  23.21 
 
 
412 aa  57.4  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  25.13 
 
 
401 aa  57  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  26.15 
 
 
403 aa  57  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  25.37 
 
 
419 aa  53.5  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  23.31 
 
 
415 aa  47.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  22.3 
 
 
416 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  24.07 
 
 
439 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  23.6 
 
 
406 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>