50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2199 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2199  Mn2+/Fe2- transporter, NRAMP family  100 
 
 		 414 aa  787    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19210  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  66.67 
 
 		 427 aa  515  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00410  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  68.2 
 
 		 426 aa  507  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5193  hypothetical protein  65.35 
 
 		 412 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.249883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3559  hypothetical protein  61.73 
 
 		 416 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5852  hypothetical protein  54.46 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0575384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0496  hypothetical protein  53.83 
 
 		 410 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0319  hypothetical protein  54.68 
 
 		 411 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5377  hypothetical protein  52.36 
 
 		 410 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31598  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0028  permease (transport protein)  49.6 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0536  hypothetical protein  55.48 
 
 		 421 aa  378  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131848  decreased coverage  0.00419582 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1443  putative transmembrane transport protein  47.72 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1097  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  47.7 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0711  transmembrane transport protein  50.38 
 
 		 406 aa  354  1e-96  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2227  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  47.38 
 
 		 394 aa  346  4e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4281  putative transmembrane transport protein  50 
 
 		 386 aa  346  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1695  hypothetical protein  45.98 
 
 		 409 aa  343  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1661  manganese transporter NRAMP  45.98 
 
 		 409 aa  343  2e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3381  manganese transporter NRAMP  46.21 
 
 		 408 aa  340  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.764333 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1167  hypothetical protein  46.87 
 
 		 414 aa  330  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.367951  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0987  manganese transporter NRAMP  43.65 
 
 		 410 aa  315  7e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0438146  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000480  hypothetical protein  41.67 
 
 		 412 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3271  manganese transporter NRAMP  39.46 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  25.82 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  26.19 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  24.05 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.3 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  28.12 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  22.83 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  22.58 
 
 		 434 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  24.82 
 
 		 439 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  25 
 
 		 403 aa  52.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  22.2 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  25.36 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  25.36 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  25.36 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  25.12 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  25.12 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  25.12 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  25.12 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  25.12 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.12 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  25.14 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1064  natural resistance-associated macrophage protein  27.7 
 
 		 430 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.262705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0733  natural resistance-associated macrophage protein  25.78 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1815  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.26 
 
 		 409 aa  46.6  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  23.08 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  24.64 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  24.94 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  23.8 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>