More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08916 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  100 
 
 
403 aa  779    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  51.01 
 
 
397 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  41.09 
 
 
412 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  40.45 
 
 
406 aa  306  5.0000000000000004e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  41.83 
 
 
408 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  38.85 
 
 
401 aa  299  5e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  41.73 
 
 
415 aa  296  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  39.61 
 
 
416 aa  289  7e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  41.81 
 
 
419 aa  283  5.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  39.59 
 
 
398 aa  278  8e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0733  natural resistance-associated macrophage protein  35.92 
 
 
422 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1064  natural resistance-associated macrophage protein  36.8 
 
 
430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.262705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  31.27 
 
 
432 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.83 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  29.53 
 
 
432 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  28 
 
 
408 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  27.88 
 
 
415 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  26.54 
 
 
427 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  25.91 
 
 
404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  24.5 
 
 
414 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  25.91 
 
 
414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  27.46 
 
 
401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  28.1 
 
 
452 aa  126  8.000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  27.78 
 
 
432 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  24.81 
 
 
434 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  27.54 
 
 
423 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  27.34 
 
 
417 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25 
 
 
432 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  27.64 
 
 
418 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  25.12 
 
 
428 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  27.82 
 
 
412 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  26.72 
 
 
412 aa  123  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  26.35 
 
 
411 aa  123  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  26.96 
 
 
439 aa  123  7e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  27.07 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.07 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  27.07 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  27.07 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  27.07 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  27.07 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  27.07 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  27.07 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  27.07 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  26.23 
 
 
409 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  26.23 
 
 
409 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  25.56 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  23.97 
 
 
432 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  29.19 
 
 
622 aa  118  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  26.32 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  26.15 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  27 
 
 
412 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  24.74 
 
 
442 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  25.39 
 
 
441 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0222  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.76 
 
 
439 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  26.18 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  26.18 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1050  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.06 
 
 
441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  26.18 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  26.18 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  26.18 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  26.5 
 
 
412 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  25.45 
 
 
453 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4366  manganese transporter NRAMP  23.75 
 
 
408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4453  Mn2+/Fe2+ transporter  23.75 
 
 
408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.0620923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4747  Mn2+/Fe2+ transporter  23.75 
 
 
408 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  25.06 
 
 
434 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  26.94 
 
 
410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  25.97 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  23.6 
 
 
439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.18 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0999  NRAMP family Mn2+ and Fe2+ transporter  24.45 
 
 
455 aa  111  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  25.69 
 
 
433 aa  110  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  25.97 
 
 
463 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  25.66 
 
 
425 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  24.69 
 
 
425 aa  106  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  24.12 
 
 
423 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  25.54 
 
 
431 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.52 
 
 
439 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1822  Mn2+/Fe2+ transporter  22.25 
 
 
407 aa  104  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  25 
 
 
420 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.13 
 
 
450 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  25.47 
 
 
426 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  29.41 
 
 
431 aa  103  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  24.67 
 
 
445 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  30.09 
 
 
627 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  26.71 
 
 
431 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  23.95 
 
 
436 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  23.95 
 
 
436 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  23.95 
 
 
436 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  23.12 
 
 
438 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.32 
 
 
463 aa  101  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  24.71 
 
 
453 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  24.1 
 
 
431 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  24.1 
 
 
431 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  23.61 
 
 
431 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  24.46 
 
 
438 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.9 
 
 
448 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.03 
 
 
413 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  23.63 
 
 
441 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  24.11 
 
 
463 aa  99.8  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>