More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3815 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 		 408 aa  800    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  47.41 
 
 		 412 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  47.1 
 
 		 416 aa  343  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  46.37 
 
 		 415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  45.32 
 
 		 419 aa  326  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  46.32 
 
 		 406 aa  323  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  41.83 
 
 		 403 aa  318  7.999999999999999e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  43.8 
 
 		 401 aa  318  1e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  45.01 
 
 		 397 aa  305  7e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  42.42 
 
 		 398 aa  281  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0733  natural resistance-associated macrophage protein  34.53 
 
 		 422 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1064  natural resistance-associated macrophage protein  38.04 
 
 		 430 aa  182  6e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.262705  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  29.46 
 
 		 415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  32.39 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  29.35 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  28.71 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  29.33 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  27.99 
 
 		 432 aa  153  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  30.26 
 
 		 452 aa  150  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  27.6 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  27.95 
 
 		 401 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  28.47 
 
 		 417 aa  132  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  28.65 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  25.66 
 
 		 428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  26.88 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  26.63 
 
 		 427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  26.98 
 
 		 415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  28.33 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  28.33 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  28.33 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  28.33 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  29.68 
 
 		 438 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  28.33 
 
 		 437 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  26.09 
 
 		 414 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  28.85 
 
 		 452 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  24.62 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  28.4 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  26.9 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  25.96 
 
 		 463 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  29.49 
 
 		 422 aa  117  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  26.3 
 
 		 412 aa  116  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  26.55 
 
 		 412 aa  116  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  27.46 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  26.72 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  26.72 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  26.72 
 
 		 438 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  25.43 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  27.09 
 
 		 438 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  27.41 
 
 		 438 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  26.91 
 
 		 423 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0339  manganese transporter NRAMP  25.4 
 
 		 464 aa  113  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00143426  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  27.48 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  27.75 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  27.48 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  27.16 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  27.48 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  27.48 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  27.48 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  27.16 
 
 		 409 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  26.17 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  25.26 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  27.43 
 
 		 423 aa  110  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  26.68 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  26.68 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  26.68 
 
 		 412 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.68 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  27.46 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  26.68 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  23.72 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  26.68 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  26.68 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  26.68 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  27.65 
 
 		 463 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  26.68 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  28.93 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0222  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.65 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  28.14 
 
 		 448 aa  107  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  29.04 
 
 		 622 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  29.46 
 
 		 416 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  27.72 
 
 		 456 aa  107  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  25.84 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2183  manganese transporter NRAMP  30.16 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0049052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.52 
 
 		 432 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.94 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  28.52 
 
 		 428 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  23.56 
 
 		 434 aa  103  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  28.47 
 
 		 442 aa  103  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  25.49 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  26.13 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  27.16 
 
 		 442 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  23.72 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  24.67 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  24.67 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  24.67 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  26.28 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  26.91 
 
 		 438 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  24.4 
 
 		 435 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  25.92 
 
 		 462 aa  100  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  24.67 
 
 		 441 aa  99.8  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  28.32 
 
 		 429 aa  99.8  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>