257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1689 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
401 aa  779    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  67.25 
 
 
428 aa  545  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  32.55 
 
 
439 aa  232  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  30.27 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  29.34 
 
 
419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  30.92 
 
 
412 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  28.4 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  28.78 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  27.61 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  28.13 
 
 
408 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  29.02 
 
 
398 aa  129  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  27.46 
 
 
403 aa  127  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  29.12 
 
 
415 aa  123  5e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  25.97 
 
 
408 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  29.03 
 
 
432 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  26.41 
 
 
432 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  27.41 
 
 
418 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  28.18 
 
 
418 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  26.79 
 
 
452 aa  105  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  28.47 
 
 
432 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1353  natural resistance-associated macrophage protein  26.88 
 
 
455 aa  101  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.573768  normal  0.0815096 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  26.28 
 
 
415 aa  100  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  22.46 
 
 
425 aa  97.4  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2242  natural resistance-associated macrophage protein  27.64 
 
 
447 aa  93.2  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  24.76 
 
 
433 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  23.29 
 
 
404 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  23.19 
 
 
441 aa  91.3  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.68 
 
 
434 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2933  natural resistance-associated macrophage protein  26.35 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  21.82 
 
 
435 aa  86.3  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.3 
 
 
432 aa  86.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  23.28 
 
 
414 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  25.88 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  27.23 
 
 
415 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  26.29 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  27.21 
 
 
428 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  26.29 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3643  natural resistance-associated macrophage protein  26.5 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.145249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  22.96 
 
 
434 aa  80.1  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  25.65 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  24.88 
 
 
435 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  23.75 
 
 
417 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  26.48 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4366  manganese transporter NRAMP  23.83 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  22.94 
 
 
432 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4453  Mn2+/Fe2+ transporter  23.83 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.0620923 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  22.52 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  23.48 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  24.05 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4747  Mn2+/Fe2+ transporter  23.83 
 
 
408 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1822  Mn2+/Fe2+ transporter  22.16 
 
 
407 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.94 
 
 
420 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  25 
 
 
431 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  26.29 
 
 
435 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  25.66 
 
 
430 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  21.67 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.81 
 
 
429 aa  76.3  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  21.28 
 
 
414 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  25 
 
 
430 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  24.23 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  25 
 
 
430 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  24.18 
 
 
428 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  23.67 
 
 
442 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  24.82 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  24.64 
 
 
429 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  22.31 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  26.54 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  23 
 
 
463 aa  73.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  22.85 
 
 
429 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  26.47 
 
 
429 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  22.37 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0541  Mn2+/Fe2+ transporter  26.32 
 
 
457 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  24.48 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  22.22 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  23.19 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  27.14 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  24.87 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  24.87 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.86 
 
 
446 aa  71.2  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  24.87 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  22.37 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  24.87 
 
 
392 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  22.37 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  22.37 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  24.75 
 
 
437 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0222  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  22.22 
 
 
439 aa  71.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  24.01 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  23.43 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  23.72 
 
 
432 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  24.19 
 
 
431 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3070  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.41 
 
 
416 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  25.99 
 
 
444 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  23.65 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  21.73 
 
 
450 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  24.03 
 
 
421 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  25.81 
 
 
422 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  23.94 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  23.94 
 
 
431 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.49 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  24.49 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>