299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4086 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  85.98 
 
 		 428 aa  708    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  84.38 
 
 		 430 aa  704    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 		 429 aa  853    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  84.38 
 
 		 430 aa  704    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  99.3 
 
 		 429 aa  848    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  84.15 
 
 		 430 aa  702    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  63.93 
 
 		 432 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  62.15 
 
 		 428 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  58.71 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  54.46 
 
 		 429 aa  435  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  54.57 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  52.25 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  53.28 
 
 		 423 aa  415  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  53.16 
 
 		 433 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  52.83 
 
 		 444 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  55.66 
 
 		 423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  53.92 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  51.8 
 
 		 434 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  54.15 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  54.15 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  54.72 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  52.62 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  55.34 
 
 		 422 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  53.22 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  50.37 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  50.86 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  49.26 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  51.81 
 
 		 437 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  51.71 
 
 		 447 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  48.05 
 
 		 487 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  48.05 
 
 		 484 aa  333  5e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  46.23 
 
 		 430 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  46.23 
 
 		 430 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  46.23 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  48.87 
 
 		 418 aa  328  9e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  46.45 
 
 		 434 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  45 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  44.69 
 
 		 438 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  43.59 
 
 		 409 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  40.8 
 
 		 420 aa  295  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  45.53 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  43.46 
 
 		 420 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  43.05 
 
 		 379 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  41.39 
 
 		 433 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  31.47 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  30.53 
 
 		 408 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  32.84 
 
 		 432 aa  179  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  29.28 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  30.37 
 
 		 452 aa  169  7e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  29.43 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  28.47 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  28.86 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  27.54 
 
 		 438 aa  150  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4098  manganese transporter NRAMP  29.62 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  26.82 
 
 		 412 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  29.23 
 
 		 421 aa  126  8.000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  28.65 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  27.48 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  28.54 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  25.65 
 
 		 442 aa  109  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  28.72 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  29.26 
 
 		 544 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  28.72 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  28.24 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  28.72 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  25.77 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  25.84 
 
 		 422 aa  97.4  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  25.13 
 
 		 414 aa  97.1  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  25 
 
 		 441 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  26.59 
 
 		 412 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  26.59 
 
 		 412 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  29.91 
 
 		 432 aa  96.3  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  26.59 
 
 		 412 aa  96.3  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1425  manganese/iron transporter  25.67 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  24.35 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.51 
 
 		 432 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.35 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  26.35 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  26.35 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  26.35 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  27.51 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  26.35 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  26.35 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  24.74 
 
 		 438 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  26.14 
 
 		 417 aa  93.2  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  24.25 
 
 		 434 aa  93.2  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  25.45 
 
 		 406 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  26.98 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  26.85 
 
 		 457 aa  92.4  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  27.17 
 
 		 557 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  28.19 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  28.19 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  28.89 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  25.19 
 
 		 439 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  27.17 
 
 		 557 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  27.17 
 
 		 557 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  27.17 
 
 		 590 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1258  manganese/iron transporter  25.4 
 
 		 431 aa  90.5  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  24.85 
 
 		 416 aa  90.5  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1414  manganese/iron transporter  25.4 
 
 		 437 aa  90.5  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>