More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6733 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  84.65 
 
 		 428 aa  701    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  98.84 
 
 		 430 aa  844    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  84.15 
 
 		 429 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  98.84 
 
 		 430 aa  844    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 		 430 aa  852    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  84.62 
 
 		 429 aa  707    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  64.02 
 
 		 432 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  64.39 
 
 		 428 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  56.01 
 
 		 435 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  57.01 
 
 		 429 aa  428  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  52.24 
 
 		 429 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  51.75 
 
 		 435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  50.94 
 
 		 430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  54.11 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  53.43 
 
 		 444 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  54.05 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  51.79 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  55.15 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  54.09 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  54.09 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  52.48 
 
 		 433 aa  388  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  52.62 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  51.3 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  49.65 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  50.37 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  54.46 
 
 		 422 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  48.28 
 
 		 423 aa  360  3e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  49.88 
 
 		 437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  50.58 
 
 		 447 aa  339  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  46.7 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  46.45 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  46.45 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  49.75 
 
 		 487 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  49.51 
 
 		 484 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  46.56 
 
 		 434 aa  319  5e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  46.13 
 
 		 450 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  45.43 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  47.19 
 
 		 418 aa  309  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  42.16 
 
 		 420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  41.58 
 
 		 409 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  43.72 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  47.35 
 
 		 382 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  45.11 
 
 		 379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  40.77 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  30.79 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  29.66 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  32.45 
 
 		 432 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  29.88 
 
 		 418 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  31.04 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  28.33 
 
 		 432 aa  170  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  29.75 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  28.05 
 
 		 432 aa  163  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4098  manganese transporter NRAMP  29.5 
 
 		 419 aa  153  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  26.72 
 
 		 438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  26.41 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  29.41 
 
 		 419 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  29.15 
 
 		 421 aa  123  7e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  29.34 
 
 		 421 aa  122  9e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  28.47 
 
 		 419 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  26.1 
 
 		 425 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  27.65 
 
 		 448 aa  107  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  28.31 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  26.17 
 
 		 442 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  24.35 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  28.08 
 
 		 544 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  26.85 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  25.26 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  28.5 
 
 		 398 aa  99.8  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  28.09 
 
 		 433 aa  98.6  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  24.84 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  24.55 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  27.03 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  27.03 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.03 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  27.03 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  27.03 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  27.03 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  27.03 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  27.03 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  27.03 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  27.62 
 
 		 456 aa  94  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  27.62 
 
 		 456 aa  94  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  24.94 
 
 		 422 aa  93.6  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  24.32 
 
 		 427 aa  93.2  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  28.86 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  23.92 
 
 		 403 aa  92  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  25.76 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  25.9 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  27.18 
 
 		 441 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  27.18 
 
 		 392 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  26.54 
 
 		 412 aa  90.1  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  25.63 
 
 		 439 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  25.52 
 
 		 434 aa  89.7  9e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  27.18 
 
 		 413 aa  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  27.18 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  27.18 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  26.02 
 
 		 457 aa  89.4  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  27.18 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  27.54 
 
 		 456 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  20.92 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>