247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6380 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  78.38 
 
 
434 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  85.71 
 
 
430 aa  711    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  98.42 
 
 
379 aa  751    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  85.23 
 
 
430 aa  706    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  85.71 
 
 
430 aa  711    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
450 aa  897    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  64.58 
 
 
487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  64.34 
 
 
484 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  63.12 
 
 
382 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  46.1 
 
 
423 aa  363  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  46.01 
 
 
434 aa  353  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  43.93 
 
 
428 aa  350  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  48.27 
 
 
432 aa  349  7e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  46.56 
 
 
435 aa  340  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  47.56 
 
 
423 aa  339  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  47.56 
 
 
423 aa  339  7e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  48.16 
 
 
422 aa  334  2e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  44.96 
 
 
423 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  43.39 
 
 
435 aa  329  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  45.15 
 
 
444 aa  328  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  44.77 
 
 
429 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  46.8 
 
 
430 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  46.91 
 
 
430 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  46.91 
 
 
430 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  42.52 
 
 
435 aa  322  6e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  44.91 
 
 
429 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  41.87 
 
 
423 aa  317  3e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  42.54 
 
 
434 aa  317  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  45.57 
 
 
428 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  44.17 
 
 
448 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  43.11 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  40.84 
 
 
432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  41.06 
 
 
429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  42.68 
 
 
429 aa  302  6.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  42.33 
 
 
430 aa  301  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  43.1 
 
 
439 aa  292  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  43.24 
 
 
437 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  43.51 
 
 
447 aa  280  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  43.6 
 
 
418 aa  276  6e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  34.81 
 
 
420 aa  256  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  35.85 
 
 
438 aa  253  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  35.14 
 
 
409 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  32.94 
 
 
420 aa  207  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  33.67 
 
 
433 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  29.16 
 
 
432 aa  150  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4098  manganese transporter NRAMP  29.04 
 
 
419 aa  149  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  25.69 
 
 
415 aa  140  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  28 
 
 
415 aa  136  9e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  25.67 
 
 
452 aa  134  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  27.14 
 
 
432 aa  127  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  25.06 
 
 
418 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  25.79 
 
 
432 aa  123  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  25.38 
 
 
408 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  23.41 
 
 
438 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  27.46 
 
 
414 aa  97.8  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  27.53 
 
 
434 aa  91.3  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  24.53 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  27.67 
 
 
411 aa  87  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  25.64 
 
 
419 aa  86.7  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  24.86 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  24.65 
 
 
421 aa  85.5  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  21.89 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  25.97 
 
 
401 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  25 
 
 
417 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  27.5 
 
 
441 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  26.33 
 
 
425 aa  79.7  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  22.91 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  26.27 
 
 
463 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  28.3 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  23.4 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  26.96 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  26.96 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  26.96 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.18 
 
 
439 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  27.72 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  26.84 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  26.43 
 
 
448 aa  77  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  28.71 
 
 
437 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  28.71 
 
 
437 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  28.71 
 
 
437 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  28.71 
 
 
437 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  28.71 
 
 
437 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  21.78 
 
 
544 aa  77  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.18 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  26.24 
 
 
421 aa  76.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  26.24 
 
 
421 aa  76.3  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  25.69 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  24.2 
 
 
434 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  23.8 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  24.92 
 
 
431 aa  73.2  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  27.04 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  27.04 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  21.03 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.59 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  25.4 
 
 
426 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  24.47 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  20.47 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  22.91 
 
 
547 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  27.95 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  23.45 
 
 
527 aa  70.9  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>