273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0529 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  100 
 
 
423 aa  844    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  66.27 
 
 
432 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  55.24 
 
 
423 aa  445  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  51.72 
 
 
423 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  50.74 
 
 
428 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  49.62 
 
 
434 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  49.39 
 
 
429 aa  375  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  48.65 
 
 
432 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  47.43 
 
 
430 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  52.81 
 
 
422 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  49.26 
 
 
429 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  49.26 
 
 
429 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  50 
 
 
428 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  46.48 
 
 
435 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  46.57 
 
 
429 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  48.53 
 
 
430 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  48.53 
 
 
430 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  45.67 
 
 
418 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  48.28 
 
 
430 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  46.72 
 
 
434 aa  343  5e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  45.3 
 
 
433 aa  341  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  44.94 
 
 
435 aa  342  1e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  46.28 
 
 
439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  45.06 
 
 
444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  46.23 
 
 
435 aa  336  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  46.8 
 
 
423 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  46.8 
 
 
423 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  41.13 
 
 
430 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  41.13 
 
 
430 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  41.38 
 
 
430 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  41.87 
 
 
450 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  44.58 
 
 
448 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  44.96 
 
 
437 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  40.9 
 
 
434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  42.22 
 
 
420 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  42 
 
 
438 aa  297  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  43.96 
 
 
447 aa  292  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  41.79 
 
 
487 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  41.79 
 
 
484 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  40.27 
 
 
379 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  40.86 
 
 
420 aa  269  8.999999999999999e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  39.52 
 
 
382 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  36.89 
 
 
409 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  36.57 
 
 
433 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  31.59 
 
 
415 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  31.44 
 
 
432 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  30.25 
 
 
415 aa  164  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  30.83 
 
 
432 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  29.58 
 
 
432 aa  160  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  30.9 
 
 
408 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  28.4 
 
 
452 aa  149  7e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  30.6 
 
 
418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  27.67 
 
 
438 aa  134  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4098  manganese transporter NRAMP  27.2 
 
 
419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  26.84 
 
 
422 aa  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  25.99 
 
 
544 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  25.36 
 
 
442 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  28.34 
 
 
421 aa  102  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  28.81 
 
 
421 aa  100  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  24.16 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  24.75 
 
 
425 aa  90.9  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  27.14 
 
 
547 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  27.07 
 
 
547 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  27.07 
 
 
547 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  27.14 
 
 
547 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  26.82 
 
 
547 aa  89.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  27.18 
 
 
547 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  28.49 
 
 
448 aa  89  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  25.68 
 
 
419 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  25.37 
 
 
415 aa  87.8  3e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  27.95 
 
 
547 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  25.27 
 
 
416 aa  87.8  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  27.44 
 
 
547 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  26.6 
 
 
557 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  26.89 
 
 
421 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  26.89 
 
 
421 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  26.89 
 
 
557 aa  86.7  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  26.89 
 
 
557 aa  86.7  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  26.6 
 
 
590 aa  86.3  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  27.11 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  24.16 
 
 
419 aa  84  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  26.8 
 
 
553 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  26.89 
 
 
565 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  25.54 
 
 
421 aa  82  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  26.67 
 
 
552 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  27.68 
 
 
527 aa  80.9  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  23.46 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  25 
 
 
425 aa  78.2  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  26.23 
 
 
548 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0493  manganese/iron transporter  27.14 
 
 
552 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  23.54 
 
 
397 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  23.56 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  24.44 
 
 
554 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  26.35 
 
 
548 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  25.58 
 
 
442 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  26.35 
 
 
548 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3507  natural resistance-associated macrophage protein  26.47 
 
 
548 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  24.59 
 
 
456 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  26.89 
 
 
558 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0313  manganese transporter NRAMP  26.6 
 
 
591 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>