291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0879 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  100 
 
 		 448 aa  896    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  60.14 
 
 		 435 aa  498  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  60.51 
 
 		 435 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  56.85 
 
 		 444 aa  481  1e-134  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  58.77 
 
 		 428 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  56.8 
 
 		 429 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  56.82 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  58.96 
 
 		 429 aa  456  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  58.02 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  55.18 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  55.75 
 
 		 432 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  52.07 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  54.11 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  52.36 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  53.88 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  53.88 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  57.31 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  54.96 
 
 		 429 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  57.31 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  54.72 
 
 		 429 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  54.52 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  50.86 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  53.56 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  49.63 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  51.9 
 
 		 422 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  51.36 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  51.36 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  50.12 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  48.47 
 
 		 432 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  45.91 
 
 		 430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  45.91 
 
 		 430 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  45.65 
 
 		 430 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  44.88 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  44.69 
 
 		 423 aa  334  1e-90  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  44.17 
 
 		 450 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  46.06 
 
 		 487 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  45.81 
 
 		 484 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  41.03 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  41.1 
 
 		 438 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  43.35 
 
 		 379 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  40.66 
 
 		 409 aa  274  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  43.85 
 
 		 382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  42.89 
 
 		 420 aa  259  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  38.12 
 
 		 433 aa  229  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  30.41 
 
 		 418 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  31.53 
 
 		 415 aa  170  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4098  manganese transporter NRAMP  30.35 
 
 		 419 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  26.97 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  30.05 
 
 		 432 aa  160  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  27.42 
 
 		 432 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  27.8 
 
 		 408 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  28.4 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  29.58 
 
 		 452 aa  156  8e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  26.67 
 
 		 438 aa  130  6e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  28.81 
 
 		 419 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  29.27 
 
 		 456 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  29.27 
 
 		 456 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  24.03 
 
 		 412 aa  114  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  27.07 
 
 		 456 aa  111  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  27.14 
 
 		 419 aa  109  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  27.53 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  27.64 
 
 		 421 aa  108  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  24.75 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  29.16 
 
 		 544 aa  103  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  27.92 
 
 		 422 aa  100  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  26.15 
 
 		 416 aa  99.8  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  26.9 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  25.7 
 
 		 434 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  29.64 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  26.57 
 
 		 542 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  27.36 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  24.04 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  24.88 
 
 		 442 aa  94  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  26.29 
 
 		 434 aa  93.6  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  27.6 
 
 		 554 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  27.38 
 
 		 445 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5209  putative Mn2+/Fe2+ transporter protein  29.38 
 
 		 406 aa  91.7  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112749  normal  0.693685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  24.25 
 
 		 406 aa  91.3  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  25.78 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  25.71 
 
 		 457 aa  89.7  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  25 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  24.86 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  26.09 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  26.5 
 
 		 439 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  24.86 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  26.57 
 
 		 416 aa  88.2  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  26.04 
 
 		 415 aa  87.8  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  25.72 
 
 		 436 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  25.72 
 
 		 436 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  25.72 
 
 		 436 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  27.56 
 
 		 553 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  25.71 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  26.33 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  26.06 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  27.84 
 
 		 547 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  26.28 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  27.84 
 
 		 547 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  26.56 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  27.59 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>