286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3712 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  72.89 
 
 		 547 aa  726    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  71.93 
 
 		 547 aa  714    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  73.35 
 
 		 547 aa  728    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  70.3 
 
 		 542 aa  685    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  64.01 
 
 		 552 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  67.04 
 
 		 548 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  73.92 
 
 		 547 aa  720    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  100 
 
 		 553 aa  1072    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  73.35 
 
 		 547 aa  728    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  73.57 
 
 		 547 aa  721    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  73.2 
 
 		 547 aa  720    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  70.52 
 
 		 544 aa  729    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  65.75 
 
 		 557 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  73.63 
 
 		 547 aa  733    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  65.75 
 
 		 590 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  65.75 
 
 		 557 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  75.51 
 
 		 554 aa  756    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  65.56 
 
 		 557 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  66.67 
 
 		 565 aa  632  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  66.79 
 
 		 548 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3507  natural resistance-associated macrophage protein  66.79 
 
 		 548 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  66.98 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0269  manganese/iron transporter  67.16 
 
 		 644 aa  627  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4756  natural resistance-associated macrophage protein  67.72 
 
 		 548 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4233  natural resistance-associated macrophage protein  67.72 
 
 		 548 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.694052 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0493  manganese/iron transporter  66.48 
 
 		 552 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  65.56 
 
 		 558 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0313  manganese transporter NRAMP  65.56 
 
 		 591 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4721  putative natural resistance-associated macrophage protein  65.41 
 
 		 547 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912608  normal  0.040481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7399  putative manganese transport protein  63.25 
 
 		 548 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1740  natural resistance-associated macrophage protein  60.92 
 
 		 557 aa  529  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  55.97 
 
 		 565 aa  484  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  48.01 
 
 		 527 aa  352  7e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  41.11 
 
 		 422 aa  283  5.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  38.64 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  40 
 
 		 421 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  38.76 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  38.76 
 
 		 456 aa  244  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  38.35 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  37.44 
 
 		 457 aa  240  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  38.13 
 
 		 448 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  35.68 
 
 		 442 aa  233  8.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  36.71 
 
 		 421 aa  226  1e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  37.53 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  32.75 
 
 		 415 aa  210  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  37.53 
 
 		 419 aa  200  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  31.12 
 
 		 418 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  32.75 
 
 		 408 aa  190  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  32.14 
 
 		 432 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  35.95 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  35.95 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  31.65 
 
 		 432 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  32.19 
 
 		 415 aa  179  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  36.03 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  28.38 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  34.67 
 
 		 448 aa  163  6e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  30.37 
 
 		 432 aa  160  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  29.54 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0827  manganese transporter NRAMP  35.47 
 
 		 431 aa  154  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  34.83 
 
 		 413 aa  146  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  27.45 
 
 		 430 aa  110  8.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  27.78 
 
 		 420 aa  105  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  26.44 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  25.95 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  28.64 
 
 		 432 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  27.86 
 
 		 429 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  27.95 
 
 		 439 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  26.3 
 
 		 423 aa  93.6  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  28.61 
 
 		 428 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  26.4 
 
 		 434 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  27.07 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  27.79 
 
 		 429 aa  92.8  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  27.79 
 
 		 429 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  28.47 
 
 		 432 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  27 
 
 		 435 aa  90.9  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  25.88 
 
 		 429 aa  87.8  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  24.82 
 
 		 423 aa  87.4  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  27.98 
 
 		 435 aa  87  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  27.56 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  24.36 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  27.01 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  29.21 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  25.91 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  26.12 
 
 		 414 aa  83.2  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  27.51 
 
 		 438 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  27.51 
 
 		 438 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  27.51 
 
 		 438 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  27.83 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  27.14 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  25.97 
 
 		 403 aa  82.4  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  25.28 
 
 		 418 aa  82  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  27.42 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  27.42 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  26.67 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  23.44 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  26.35 
 
 		 433 aa  79.7  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  29.62 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2576  manganese/iron transporter  30 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.202281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  28.54 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1332  manganese/iron transporter  30 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>