292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7455 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  69.2 
 
 
547 aa  699    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  70.43 
 
 
554 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  66.67 
 
 
557 aa  675    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  70.87 
 
 
547 aa  709    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0493  manganese/iron transporter  67.77 
 
 
552 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  70.06 
 
 
553 aa  673    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  67.65 
 
 
548 aa  664    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  70.69 
 
 
547 aa  707    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0269  manganese/iron transporter  69.03 
 
 
644 aa  658    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  70.53 
 
 
547 aa  712    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  70.69 
 
 
547 aa  711    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  66.85 
 
 
557 aa  678    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3507  natural resistance-associated macrophage protein  66.42 
 
 
548 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4233  natural resistance-associated macrophage protein  66.97 
 
 
548 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.694052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  100 
 
 
542 aa  1066    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  70.87 
 
 
547 aa  710    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  67.16 
 
 
565 aa  657    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  66.42 
 
 
548 aa  654    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4756  natural resistance-associated macrophage protein  66.97 
 
 
548 aa  644    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  66.24 
 
 
548 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  66.73 
 
 
552 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  66.85 
 
 
557 aa  678    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  70.53 
 
 
547 aa  712    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  66.85 
 
 
590 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  73.47 
 
 
544 aa  776    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  70.87 
 
 
547 aa  711    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  67.03 
 
 
558 aa  657    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0313  manganese transporter NRAMP  67.03 
 
 
591 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4721  putative natural resistance-associated macrophage protein  66.36 
 
 
547 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912608  normal  0.040481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7399  putative manganese transport protein  65.18 
 
 
548 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248778  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1740  natural resistance-associated macrophage protein  59.62 
 
 
557 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  54.46 
 
 
565 aa  482  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  47.48 
 
 
527 aa  360  3e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  39.15 
 
 
422 aa  277  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  37.8 
 
 
425 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  40.43 
 
 
421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  37.59 
 
 
456 aa  257  3e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  34.58 
 
 
456 aa  252  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  34.58 
 
 
456 aa  252  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  36.6 
 
 
421 aa  250  5e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  36.87 
 
 
421 aa  250  6e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  37.41 
 
 
448 aa  247  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  39.21 
 
 
457 aa  243  7e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  33.65 
 
 
442 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  32.17 
 
 
432 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  32.07 
 
 
418 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  33.33 
 
 
408 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  33.07 
 
 
415 aa  204  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  36.53 
 
 
419 aa  203  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  31.65 
 
 
432 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  34.86 
 
 
421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  34.86 
 
 
421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  30.85 
 
 
415 aa  188  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  34 
 
 
416 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  35.92 
 
 
448 aa  183  9.000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  30.79 
 
 
452 aa  172  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  33 
 
 
432 aa  166  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  34.25 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  28.47 
 
 
438 aa  149  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0827  manganese transporter NRAMP  31.94 
 
 
431 aa  144  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  26.34 
 
 
430 aa  113  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  29.38 
 
 
432 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  25.54 
 
 
428 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  26.34 
 
 
423 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  25.95 
 
 
434 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  28.75 
 
 
439 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  29.87 
 
 
406 aa  101  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  26.23 
 
 
420 aa  101  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  26.24 
 
 
429 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  26.55 
 
 
435 aa  97.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  27.88 
 
 
414 aa  97.4  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  24.77 
 
 
423 aa  94.7  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  26.03 
 
 
412 aa  92.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  26.57 
 
 
448 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  25.32 
 
 
435 aa  90.9  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  26.12 
 
 
418 aa  90.5  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  27.06 
 
 
434 aa  90.5  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  27.78 
 
 
429 aa  88.2  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  27.38 
 
 
398 aa  87.4  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  29.47 
 
 
419 aa  87  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  26.93 
 
 
432 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  29.65 
 
 
428 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0451  natural resistance-associated macrophage protein  27.97 
 
 
399 aa  86.3  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  26.01 
 
 
423 aa  86.3  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  24.56 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  25.91 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  30.73 
 
 
442 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  30.72 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  29.77 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  26.22 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  26.83 
 
 
422 aa  84  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  25.5 
 
 
403 aa  84  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  31.25 
 
 
438 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  31.15 
 
 
435 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  31.46 
 
 
436 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  31.46 
 
 
436 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  31.46 
 
 
436 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  27.4 
 
 
441 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  25.15 
 
 
444 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1208  manganese transporter, putative  25.25 
 
 
424 aa  82  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>