More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0068 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 		 452 aa  909    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  52.7 
 
 		 438 aa  451  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  49.09 
 
 		 415 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  46.81 
 
 		 418 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  46.38 
 
 		 408 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  45.1 
 
 		 432 aa  363  4e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  44.42 
 
 		 432 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  45.2 
 
 		 432 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  43.28 
 
 		 415 aa  352  8.999999999999999e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  35.7 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  34.96 
 
 		 421 aa  223  4e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  34.7 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  36.19 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  31.58 
 
 		 438 aa  199  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  32.91 
 
 		 420 aa  199  7e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  34.51 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  33.33 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  35.01 
 
 		 434 aa  194  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  33.41 
 
 		 429 aa  190  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  32.6 
 
 		 419 aa  188  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  33.08 
 
 		 420 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  30.61 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  30.69 
 
 		 448 aa  182  7e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  31.2 
 
 		 544 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  31.01 
 
 		 456 aa  176  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  33.77 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  32.17 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  32.49 
 
 		 565 aa  170  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  31.28 
 
 		 430 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  31.28 
 
 		 430 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  32.43 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  31.19 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  32.43 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  31.04 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  31.2 
 
 		 547 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  31.44 
 
 		 547 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  31.44 
 
 		 547 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  29.91 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  32.23 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  30.1 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  30.94 
 
 		 547 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  30.1 
 
 		 423 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  30.73 
 
 		 432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  30.94 
 
 		 547 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  30.94 
 
 		 547 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  31.67 
 
 		 439 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  29.33 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  30.37 
 
 		 429 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0827  manganese transporter NRAMP  31.3 
 
 		 431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  30.69 
 
 		 547 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  30.86 
 
 		 429 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  30.44 
 
 		 435 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  30.02 
 
 		 542 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  30.16 
 
 		 527 aa  162  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  31.03 
 
 		 432 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  32.42 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  30.3 
 
 		 435 aa  161  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  30.83 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  30.06 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  27.93 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  31.36 
 
 		 429 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  29.7 
 
 		 554 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  27.92 
 
 		 553 aa  156  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  30.61 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  29.54 
 
 		 412 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  29.12 
 
 		 437 aa  152  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  29.37 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  30.61 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1740  natural resistance-associated macrophage protein  29.78 
 
 		 557 aa  150  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  29.84 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7399  putative manganese transport protein  29.31 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  29.03 
 
 		 548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3507  natural resistance-associated macrophage protein  29.03 
 
 		 548 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  28.78 
 
 		 548 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  28.78 
 
 		 548 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  27.64 
 
 		 552 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  30.07 
 
 		 422 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  28.4 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  29.98 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  29.75 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  29.46 
 
 		 448 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  28.54 
 
 		 565 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  30.26 
 
 		 408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  28.04 
 
 		 557 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  28.04 
 
 		 557 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  28.04 
 
 		 590 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  28.04 
 
 		 557 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  26.09 
 
 		 434 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  30.83 
 
 		 433 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  28.62 
 
 		 421 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  28.62 
 
 		 421 aa  136  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  26.52 
 
 		 414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  29.87 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4721  putative natural resistance-associated macrophage protein  27.52 
 
 		 547 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912608  normal  0.040481 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  25.67 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0269  manganese/iron transporter  29.53 
 
 		 644 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  28.29 
 
 		 558 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  23.88 
 
 		 430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0313  manganese transporter NRAMP  28.29 
 
 		 591 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  28.98 
 
 		 418 aa  131  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>