More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2339 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
432 aa  839    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  48.76 
 
 
415 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  48.85 
 
 
418 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  49.23 
 
 
408 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  48.45 
 
 
432 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  46.67 
 
 
432 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  47.93 
 
 
415 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  45.2 
 
 
452 aa  358  9.999999999999999e-98  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  46.97 
 
 
438 aa  330  4e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  33.25 
 
 
425 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  33.41 
 
 
420 aa  200  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  36.34 
 
 
421 aa  200  5e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  36.59 
 
 
421 aa  199  6e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  34.68 
 
 
423 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  31.58 
 
 
430 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  35.64 
 
 
429 aa  187  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  32.44 
 
 
420 aa  186  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  31.72 
 
 
433 aa  186  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  32.89 
 
 
422 aa  182  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  34.63 
 
 
565 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  34.65 
 
 
419 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  33.1 
 
 
435 aa  176  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  32.94 
 
 
430 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  32.94 
 
 
430 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  33.08 
 
 
421 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  32.84 
 
 
429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  32.84 
 
 
429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  32.45 
 
 
430 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  31.5 
 
 
428 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  32.77 
 
 
423 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  33.59 
 
 
432 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  31.68 
 
 
484 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  31.68 
 
 
487 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  32.37 
 
 
438 aa  169  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  32 
 
 
429 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  31.13 
 
 
412 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  31.32 
 
 
439 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  33.57 
 
 
418 aa  167  5e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  31.44 
 
 
423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  32.45 
 
 
428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  31.94 
 
 
434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  31.74 
 
 
432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  31.74 
 
 
554 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  30.63 
 
 
544 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  31.62 
 
 
435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  32.3 
 
 
444 aa  163  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  32.15 
 
 
542 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  34.31 
 
 
527 aa  161  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  32.58 
 
 
448 aa  159  6e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  31.16 
 
 
457 aa  158  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  31.08 
 
 
434 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  31.95 
 
 
433 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  33.08 
 
 
437 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  32.39 
 
 
408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  32.34 
 
 
416 aa  153  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  28.24 
 
 
442 aa  153  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  31.64 
 
 
421 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  31.25 
 
 
423 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  30.5 
 
 
435 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  31.25 
 
 
423 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  31.64 
 
 
421 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  32.17 
 
 
547 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  32.17 
 
 
547 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  31.57 
 
 
547 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  31.2 
 
 
401 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  31.44 
 
 
422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  30.83 
 
 
447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  30.45 
 
 
552 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  31.57 
 
 
547 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  29.87 
 
 
548 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  32.17 
 
 
547 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  28.88 
 
 
557 aa  146  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  27.48 
 
 
430 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  27.48 
 
 
430 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  29.87 
 
 
565 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  28.88 
 
 
557 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  28.88 
 
 
557 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  28.97 
 
 
450 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  30.53 
 
 
553 aa  146  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  28.88 
 
 
590 aa  146  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  32.17 
 
 
547 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  27.12 
 
 
434 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  31.92 
 
 
547 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  27.23 
 
 
430 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3507  natural resistance-associated macrophage protein  29.62 
 
 
548 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  29.62 
 
 
548 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  30.43 
 
 
419 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  31.67 
 
 
547 aa  142  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  29.37 
 
 
548 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7399  putative manganese transport protein  34.35 
 
 
548 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248778  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  32.04 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  29.73 
 
 
456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  29.73 
 
 
456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  30.05 
 
 
448 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  30.65 
 
 
382 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4756  natural resistance-associated macrophage protein  29.83 
 
 
548 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4233  natural resistance-associated macrophage protein  29.83 
 
 
548 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.694052 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  31.51 
 
 
415 aa  137  4e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4721  putative natural resistance-associated macrophage protein  28.86 
 
 
547 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912608  normal  0.040481 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  28.64 
 
 
558 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>