299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7276 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  100 
 
 
435 aa  868    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  64.07 
 
 
435 aa  558  1e-158  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  65.4 
 
 
435 aa  531  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  61.1 
 
 
444 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  60.97 
 
 
439 aa  495  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  59.81 
 
 
429 aa  470  1.0000000000000001e-131  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  58.09 
 
 
428 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  60.97 
 
 
447 aa  461  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  54.98 
 
 
429 aa  457  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  59.56 
 
 
448 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  59.95 
 
 
437 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  55.28 
 
 
423 aa  425  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  55.15 
 
 
428 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  56.54 
 
 
430 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  56.54 
 
 
430 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  56.3 
 
 
430 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  52.53 
 
 
423 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  54.22 
 
 
429 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  54.66 
 
 
429 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  54.89 
 
 
432 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  54.23 
 
 
433 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  52.07 
 
 
434 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  52.33 
 
 
430 aa  409  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  52.86 
 
 
422 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  47.23 
 
 
434 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  52.12 
 
 
423 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  52.12 
 
 
423 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  50.12 
 
 
418 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  49.27 
 
 
432 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  47.09 
 
 
423 aa  365  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  45.41 
 
 
430 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  45.41 
 
 
430 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  44.91 
 
 
430 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  46.17 
 
 
450 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  44.72 
 
 
434 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  46.49 
 
 
487 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  46.49 
 
 
484 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  44.81 
 
 
438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  41.29 
 
 
420 aa  296  5e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  43.43 
 
 
379 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  44.28 
 
 
420 aa  279  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  43.83 
 
 
382 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  39.39 
 
 
409 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  37.17 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  31.27 
 
 
415 aa  176  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  32.87 
 
 
432 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  32.43 
 
 
418 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  30.44 
 
 
452 aa  162  9e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  29.37 
 
 
432 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  29.93 
 
 
408 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  28.77 
 
 
432 aa  156  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  31.9 
 
 
415 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4098  manganese transporter NRAMP  30.37 
 
 
419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  28.65 
 
 
438 aa  142  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  26.92 
 
 
412 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  27.99 
 
 
421 aa  111  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  27.74 
 
 
421 aa  109  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  27.21 
 
 
419 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  27.72 
 
 
544 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  25.8 
 
 
425 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  27.44 
 
 
422 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.17 
 
 
439 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  26.29 
 
 
527 aa  97.1  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  26.53 
 
 
415 aa  96.3  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  24.48 
 
 
442 aa  96.3  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  25.31 
 
 
416 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  26.79 
 
 
398 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  24.44 
 
 
421 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  26.55 
 
 
406 aa  93.6  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  25.37 
 
 
448 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  23.83 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.8 
 
 
444 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  24.19 
 
 
403 aa  89.7  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  24.7 
 
 
442 aa  89  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  25.78 
 
 
450 aa  89.4  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  26.24 
 
 
419 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  26.33 
 
 
401 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  26.3 
 
 
456 aa  89  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  26.3 
 
 
456 aa  89  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  26.91 
 
 
439 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  27 
 
 
421 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  27 
 
 
421 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  23.51 
 
 
411 aa  86.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  25.61 
 
 
457 aa  86.3  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  22.39 
 
 
414 aa  86.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  25.08 
 
 
453 aa  84.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  25.78 
 
 
448 aa  84.3  0.000000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  22.9 
 
 
414 aa  84  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  26.88 
 
 
448 aa  83.2  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  27.17 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  26.42 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  26.03 
 
 
441 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  26.28 
 
 
463 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.88 
 
 
430 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  24.66 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  25.31 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  26.26 
 
 
416 aa  80.9  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  27.04 
 
 
460 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  26.88 
 
 
557 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  26.88 
 
 
557 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>