297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1588 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  85.56 
 
 
547 aa  883    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
547 aa  1078    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  64.78 
 
 
557 aa  650    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  95.78 
 
 
547 aa  993    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  64.6 
 
 
557 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  95.98 
 
 
547 aa  995    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  98.35 
 
 
547 aa  1061    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  68.62 
 
 
548 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  95.6 
 
 
547 aa  991    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0269  manganese/iron transporter  65.68 
 
 
644 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  64.83 
 
 
552 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  70.74 
 
 
542 aa  704    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3507  natural resistance-associated macrophage protein  68.43 
 
 
548 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4233  natural resistance-associated macrophage protein  68.43 
 
 
548 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.694052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  68.81 
 
 
548 aa  661    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  70.81 
 
 
544 aa  741    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  67.4 
 
 
565 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  73.92 
 
 
553 aa  707    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  68.81 
 
 
548 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  64.78 
 
 
557 aa  650    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  98.35 
 
 
547 aa  1061    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  95.98 
 
 
547 aa  998    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  64.78 
 
 
590 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  69.57 
 
 
554 aa  704    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4756  natural resistance-associated macrophage protein  68.43 
 
 
548 aa  655    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0493  manganese/iron transporter  66.11 
 
 
552 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  65.15 
 
 
558 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0313  manganese transporter NRAMP  65.15 
 
 
591 aa  629  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4721  putative natural resistance-associated macrophage protein  66.22 
 
 
547 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912608  normal  0.040481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7399  putative manganese transport protein  61.8 
 
 
548 aa  536  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248778  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1740  natural resistance-associated macrophage protein  59.92 
 
 
557 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  54.53 
 
 
565 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  48.64 
 
 
527 aa  375  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  39.57 
 
 
425 aa  276  5e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  39.57 
 
 
422 aa  274  4.0000000000000004e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  40.48 
 
 
421 aa  273  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  40.1 
 
 
457 aa  264  3e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  37.02 
 
 
421 aa  245  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  36.84 
 
 
456 aa  243  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  36.84 
 
 
456 aa  243  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  39.14 
 
 
448 aa  243  9e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  36.49 
 
 
456 aa  242  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  37.47 
 
 
421 aa  239  1e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  35.16 
 
 
415 aa  224  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  35.14 
 
 
442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  32.85 
 
 
418 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  33.42 
 
 
432 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  33.17 
 
 
408 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  33 
 
 
432 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  37.04 
 
 
419 aa  192  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  31.44 
 
 
452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  31.7 
 
 
415 aa  183  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  35.47 
 
 
448 aa  177  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  34.56 
 
 
421 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  34.56 
 
 
421 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  35.07 
 
 
416 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  31.57 
 
 
432 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  31.59 
 
 
438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0827  manganese transporter NRAMP  34.03 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  32.63 
 
 
413 aa  139  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  26.5 
 
 
430 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  29.51 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  29.1 
 
 
429 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  28.5 
 
 
412 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  30 
 
 
432 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  27.18 
 
 
423 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  26.32 
 
 
418 aa  107  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  29.55 
 
 
439 aa  103  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  26.82 
 
 
423 aa  102  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  27.2 
 
 
434 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  28.91 
 
 
406 aa  100  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  26.7 
 
 
429 aa  99.4  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  25.93 
 
 
434 aa  96.3  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  28.13 
 
 
429 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  28.24 
 
 
428 aa  95.9  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  28.24 
 
 
429 aa  94.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  26.02 
 
 
438 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  30.05 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  24.49 
 
 
428 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  25.85 
 
 
435 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  27.66 
 
 
438 aa  91.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  27.55 
 
 
414 aa  90.9  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  27.58 
 
 
448 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  27.25 
 
 
435 aa  90.1  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  27.68 
 
 
433 aa  90.1  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  27.19 
 
 
438 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  28.87 
 
 
430 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  27.19 
 
 
438 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  28.22 
 
 
408 aa  88.2  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  27.19 
 
 
438 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  28.87 
 
 
430 aa  88.2  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  25.67 
 
 
404 aa  87.4  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  25.56 
 
 
437 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  27 
 
 
423 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  25.36 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  27.09 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  27.09 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  27.09 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  27.09 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  27.38 
 
 
430 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>