285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3815 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 		 423 aa  846    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 		 423 aa  846    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  58.51 
 
 		 434 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  53.41 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  54.15 
 
 		 429 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  53.9 
 
 		 429 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  54.09 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  54.93 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  54.33 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  54.33 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  52.56 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  50.5 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  52.88 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  53.3 
 
 		 428 aa  395  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  50 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  49.02 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  48.13 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  49.88 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  51.36 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  49.11 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  47.93 
 
 		 430 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  47.93 
 
 		 430 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  48.39 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  47.69 
 
 		 430 aa  362  8e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  49.64 
 
 		 487 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  49.39 
 
 		 484 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  47.56 
 
 		 450 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  48.62 
 
 		 439 aa  354  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  46.8 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  47.74 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  47.54 
 
 		 444 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  46.45 
 
 		 433 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  51.48 
 
 		 422 aa  338  8e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  48.03 
 
 		 432 aa  334  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  46.21 
 
 		 418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  46.7 
 
 		 437 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  47.45 
 
 		 382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  47.89 
 
 		 447 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  45.33 
 
 		 379 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  40.79 
 
 		 438 aa  295  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  39.26 
 
 		 420 aa  281  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  41.65 
 
 		 420 aa  279  6e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  37.68 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  36.3 
 
 		 433 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  31.41 
 
 		 415 aa  193  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  30.1 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  28.47 
 
 		 408 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  27.23 
 
 		 432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  28.47 
 
 		 432 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  30.24 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  32.37 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  27.27 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  27.74 
 
 		 438 aa  153  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4098  manganese transporter NRAMP  29.04 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  26.58 
 
 		 442 aa  119  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  26.17 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  26.08 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  26.81 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  27.2 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  27.2 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  24 
 
 		 403 aa  104  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  27.16 
 
 		 544 aa  103  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  23.67 
 
 		 397 aa  99  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  26.99 
 
 		 414 aa  96.7  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  26.33 
 
 		 415 aa  95.5  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  26.75 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  27.16 
 
 		 448 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  26.91 
 
 		 421 aa  94.4  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  26.91 
 
 		 421 aa  94.4  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  28.03 
 
 		 552 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  28.34 
 
 		 456 aa  94  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  28.34 
 
 		 456 aa  94  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  28.42 
 
 		 448 aa  92.8  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  25.53 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  28.24 
 
 		 542 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25.45 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  27.18 
 
 		 419 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  24.88 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  23.2 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  26.16 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  24.88 
 
 		 463 aa  87.8  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  22.87 
 
 		 432 aa  87  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  27.48 
 
 		 438 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  24.62 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.66 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  25.25 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  25.19 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  28.71 
 
 		 553 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  26.82 
 
 		 438 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  26.9 
 
 		 557 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  27.39 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  27.48 
 
 		 527 aa  82.8  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  27.39 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  27.39 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  26.49 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  26.49 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  25.5 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  26.49 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  26.9 
 
 		 557 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  26.49 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>