287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2017 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
413 aa  788    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  56.19 
 
 
421 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  56.19 
 
 
421 aa  388  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  54.61 
 
 
416 aa  387  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  50.64 
 
 
419 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  52.69 
 
 
448 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0827  manganese transporter NRAMP  48.11 
 
 
431 aa  302  9e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  35.25 
 
 
425 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  35.38 
 
 
421 aa  215  9e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  35.57 
 
 
421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  33.93 
 
 
422 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  34.62 
 
 
421 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  34.47 
 
 
456 aa  186  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  34.22 
 
 
456 aa  186  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  34.22 
 
 
456 aa  186  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  33.15 
 
 
418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  32.59 
 
 
415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  31.38 
 
 
415 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  35.5 
 
 
457 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  35.11 
 
 
544 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1208  manganese transporter, putative  34.79 
 
 
424 aa  176  5e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  35.26 
 
 
448 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  31.3 
 
 
432 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  32.35 
 
 
408 aa  166  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  32.72 
 
 
552 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  32.65 
 
 
542 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  29.31 
 
 
452 aa  159  7e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  33.59 
 
 
432 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  34.29 
 
 
553 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  29.18 
 
 
432 aa  156  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  32.89 
 
 
527 aa  153  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  30.87 
 
 
438 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  29.21 
 
 
442 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  34.05 
 
 
554 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  32 
 
 
557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  32.64 
 
 
547 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  32 
 
 
557 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  32 
 
 
557 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  32.64 
 
 
547 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  32.64 
 
 
547 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  32 
 
 
590 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  32.64 
 
 
547 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  33.16 
 
 
547 aa  146  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  33.78 
 
 
547 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  33.16 
 
 
547 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  32.19 
 
 
547 aa  143  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  32.81 
 
 
548 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  32.11 
 
 
565 aa  141  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  32.89 
 
 
548 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3507  natural resistance-associated macrophage protein  31.73 
 
 
548 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  31.73 
 
 
548 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  34.59 
 
 
565 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4721  putative natural resistance-associated macrophage protein  34.3 
 
 
547 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912608  normal  0.040481 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0493  manganese/iron transporter  32.27 
 
 
552 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  32.27 
 
 
558 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7399  putative manganese transport protein  34.07 
 
 
548 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248778  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0313  manganese transporter NRAMP  32.27 
 
 
591 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1740  natural resistance-associated macrophage protein  31.03 
 
 
557 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4233  natural resistance-associated macrophage protein  32.93 
 
 
548 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.694052 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4756  natural resistance-associated macrophage protein  32.93 
 
 
548 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0269  manganese/iron transporter  33.07 
 
 
644 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0451  natural resistance-associated macrophage protein  33.44 
 
 
399 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0787  manganese transporter, putative  33.44 
 
 
394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.809712  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1265  manganese transporter NRAMP  29.81 
 
 
390 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.414287  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  27.54 
 
 
429 aa  97.1  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  26.04 
 
 
435 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  27.55 
 
 
423 aa  94.4  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  24.59 
 
 
435 aa  92.8  9e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  28.09 
 
 
444 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  29.46 
 
 
439 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  26.6 
 
 
430 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  27.87 
 
 
434 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  32.17 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0287  hypothetical protein  46.02 
 
 
140 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00972659  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1309  manganese transporter NRAMP  46.02 
 
 
140 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  26.35 
 
 
432 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  28.41 
 
 
429 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1807  manganese transporter NRAMP  45.13 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  28.57 
 
 
428 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1500  natural resistance-associated macrophage protein  27.56 
 
 
396 aa  82.8  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.146818  normal  0.532247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  26.71 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  25.86 
 
 
428 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  27.07 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  27.07 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  26.13 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  27.07 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  31.92 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  26.42 
 
 
448 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  28.88 
 
 
437 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  24.05 
 
 
420 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  28.16 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  26.37 
 
 
423 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  26.59 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  25.4 
 
 
429 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  25.86 
 
 
420 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  28.21 
 
 
429 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  27.3 
 
 
401 aa  77  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  22.92 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25.2 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  26.15 
 
 
423 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>