292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4233 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  68.1 
 
 
547 aa  687    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  67.91 
 
 
547 aa  684    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  67.91 
 
 
547 aa  683    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  67.16 
 
 
547 aa  673    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  65.37 
 
 
544 aa  701    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  81.36 
 
 
557 aa  864    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0493  manganese/iron transporter  82.61 
 
 
552 aa  845    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  67.91 
 
 
547 aa  684    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  95.07 
 
 
548 aa  981    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  68.82 
 
 
554 aa  689    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0269  manganese/iron transporter  82.07 
 
 
644 aa  835    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  81 
 
 
552 aa  889    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4756  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
548 aa  1086    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  94.16 
 
 
548 aa  973    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  68.43 
 
 
547 aa  683    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  67.47 
 
 
547 aa  682    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  67.54 
 
 
547 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3507  natural resistance-associated macrophage protein  94.16 
 
 
548 aa  972    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4233  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
548 aa  1086    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.694052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  95.07 
 
 
565 aa  975    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  67.1 
 
 
542 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4721  putative natural resistance-associated macrophage protein  81.82 
 
 
547 aa  796    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912608  normal  0.040481 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  94.34 
 
 
548 aa  974    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  81.54 
 
 
557 aa  866    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  81.54 
 
 
557 aa  866    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  81.54 
 
 
590 aa  865    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  67.72 
 
 
553 aa  649    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  81.9 
 
 
558 aa  848    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0313  manganese transporter NRAMP  81.9 
 
 
591 aa  845    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7399  putative manganese transport protein  61.61 
 
 
548 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248778  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1740  natural resistance-associated macrophage protein  62.26 
 
 
557 aa  551  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  54.68 
 
 
565 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  47.4 
 
 
527 aa  369  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  39.66 
 
 
422 aa  294  3e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  37.92 
 
 
425 aa  278  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  38.88 
 
 
456 aa  253  7e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  36.87 
 
 
421 aa  249  7e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  35.46 
 
 
421 aa  246  8e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  38.17 
 
 
456 aa  246  9e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  38.17 
 
 
456 aa  246  9e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  38.04 
 
 
448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  36.03 
 
 
421 aa  242  1e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  35.97 
 
 
457 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  35.44 
 
 
442 aa  216  8e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  32.69 
 
 
415 aa  210  6e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  32.59 
 
 
408 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  36.08 
 
 
419 aa  193  5e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  32.2 
 
 
432 aa  193  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  30.48 
 
 
418 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  30.31 
 
 
432 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  32.03 
 
 
415 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  33.43 
 
 
421 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  33.43 
 
 
421 aa  173  5.999999999999999e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  33.51 
 
 
448 aa  172  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  32.34 
 
 
416 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  30.71 
 
 
432 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  28.29 
 
 
452 aa  157  5.0000000000000005e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  29.78 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  32.93 
 
 
413 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0827  manganese transporter NRAMP  32.42 
 
 
431 aa  137  5e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  27 
 
 
430 aa  110  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  26.23 
 
 
420 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  26.9 
 
 
412 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  26.92 
 
 
429 aa  95.9  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  28.61 
 
 
432 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  26.96 
 
 
423 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  27.12 
 
 
432 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  27.67 
 
 
428 aa  93.6  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  26.85 
 
 
423 aa  93.6  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1208  manganese transporter, putative  25.33 
 
 
424 aa  91.7  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  26.98 
 
 
414 aa  90.5  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  25.13 
 
 
435 aa  90.1  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  26.38 
 
 
434 aa  90.1  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  26.53 
 
 
435 aa  89.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  23.83 
 
 
434 aa  89.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  28.49 
 
 
429 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  26.29 
 
 
430 aa  87.8  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  25.47 
 
 
438 aa  87  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  26.03 
 
 
430 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  27.93 
 
 
429 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  26.03 
 
 
430 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  27.65 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  26.57 
 
 
441 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0451  natural resistance-associated macrophage protein  24.88 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  26.46 
 
 
429 aa  83.6  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  26.34 
 
 
436 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  27.64 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  26.34 
 
 
436 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  26.34 
 
 
436 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  27.98 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  23.53 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  26.41 
 
 
439 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  24.5 
 
 
453 aa  81.3  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  24.94 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  26.11 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  26.87 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  26.13 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  27.21 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  25.89 
 
 
448 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  27.21 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>