More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0308 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  100 
 
 		 448 aa  858    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  60.44 
 
 		 419 aa  459  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0827  manganese transporter NRAMP  61.8 
 
 		 431 aa  421  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  54.37 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  55.64 
 
 		 421 aa  359  5e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  55.64 
 
 		 421 aa  359  5e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  52.69 
 
 		 413 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  36.94 
 
 		 421 aa  227  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  37.22 
 
 		 421 aa  226  9e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  35.56 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  35.26 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  32.42 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  35.54 
 
 		 422 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  35.25 
 
 		 421 aa  196  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  34.96 
 
 		 457 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  31.8 
 
 		 408 aa  186  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  30.69 
 
 		 452 aa  182  7e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  31.87 
 
 		 456 aa  176  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  31.39 
 
 		 432 aa  176  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  34.43 
 
 		 456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  34.43 
 
 		 456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  35.45 
 
 		 547 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  30.68 
 
 		 432 aa  171  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  33.61 
 
 		 552 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  35.73 
 
 		 547 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  35.73 
 
 		 547 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  35.08 
 
 		 547 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  33.96 
 
 		 544 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  35.45 
 
 		 547 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  33.51 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  34.91 
 
 		 547 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  35.19 
 
 		 547 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  30.52 
 
 		 415 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  35.79 
 
 		 554 aa  167  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  34.92 
 
 		 547 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  30.75 
 
 		 442 aa  166  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  31.03 
 
 		 438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  37.5 
 
 		 565 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  35.92 
 
 		 542 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1208  manganese transporter, putative  32.28 
 
 		 424 aa  161  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  35.28 
 
 		 527 aa  160  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  33.7 
 
 		 557 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  33.7 
 
 		 557 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  33.7 
 
 		 590 aa  160  6e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  32.58 
 
 		 432 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  33.88 
 
 		 557 aa  158  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  34.67 
 
 		 553 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1740  natural resistance-associated macrophage protein  32.63 
 
 		 557 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0493  manganese/iron transporter  34.7 
 
 		 552 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0313  manganese transporter NRAMP  34.7 
 
 		 591 aa  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  34.7 
 
 		 558 aa  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  33.6 
 
 		 548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0269  manganese/iron transporter  36.2 
 
 		 644 aa  146  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7399  putative manganese transport protein  33.42 
 
 		 548 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  33.06 
 
 		 565 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  32.25 
 
 		 548 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  32.25 
 
 		 548 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4721  putative natural resistance-associated macrophage protein  33.25 
 
 		 547 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912608  normal  0.040481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3507  natural resistance-associated macrophage protein  32.25 
 
 		 548 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4756  natural resistance-associated macrophage protein  33.93 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4233  natural resistance-associated macrophage protein  33.93 
 
 		 548 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.694052 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0451  natural resistance-associated macrophage protein  34.16 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0787  manganese transporter, putative  31.94 
 
 		 394 aa  127  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.809712  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  30.67 
 
 		 401 aa  120  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  29.35 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1265  manganese transporter NRAMP  28.06 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.414287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  32.97 
 
 		 419 aa  110  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  27.34 
 
 		 430 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  27.34 
 
 		 430 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  28.23 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  27.65 
 
 		 430 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  28.34 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  27.16 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  28.72 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  28.72 
 
 		 429 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  26.65 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  29.34 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  24.65 
 
 		 420 aa  98.2  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  29.08 
 
 		 416 aa  97.1  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1500  natural resistance-associated macrophage protein  28.3 
 
 		 396 aa  94  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.146818  normal  0.532247 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  27.67 
 
 		 406 aa  93.2  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  24.62 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  26.18 
 
 		 435 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  27.57 
 
 		 444 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  28.14 
 
 		 408 aa  90.9  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  26.4 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25.55 
 
 		 412 aa  90.5  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  28.49 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  31.83 
 
 		 409 aa  87.8  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  31.83 
 
 		 409 aa  87.8  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  24.23 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  27.81 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  31.58 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  27.96 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  25.13 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  25.78 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  31.25 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  28.93 
 
 		 462 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  26.88 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  26.97 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>