More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1439 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  81.66 
 
 		 410 aa  662    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  100 
 
 		 409 aa  807    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  100 
 
 		 409 aa  807    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  77.64 
 
 		 412 aa  635    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  77.64 
 
 		 412 aa  633  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  76.28 
 
 		 411 aa  628  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  76.28 
 
 		 412 aa  624  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  76.77 
 
 		 412 aa  619  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  77.59 
 
 		 412 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  77.59 
 
 		 412 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  77.59 
 
 		 412 aa  617  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  77.59 
 
 		 412 aa  617  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  77.34 
 
 		 413 aa  615  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  77.59 
 
 		 412 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  77.59 
 
 		 412 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  77.59 
 
 		 412 aa  617  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  77.59 
 
 		 412 aa  617  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  77.59 
 
 		 412 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  79.48 
 
 		 392 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  79.48 
 
 		 392 aa  597  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  79.48 
 
 		 392 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  79.48 
 
 		 392 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  61.12 
 
 		 423 aa  501  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1815  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  57.79 
 
 		 409 aa  451  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  54.85 
 
 		 442 aa  434  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  54.52 
 
 		 439 aa  428  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  55.06 
 
 		 431 aa  425  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  53.69 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  54.32 
 
 		 411 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  51.89 
 
 		 439 aa  401  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  49.63 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  52.05 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  51.47 
 
 		 420 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  49.88 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  48.34 
 
 		 431 aa  368  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  47.77 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  47.3 
 
 		 432 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  48.4 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  48.59 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  48.85 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  48.85 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  47.42 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  47.42 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  47.42 
 
 		 436 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  48.1 
 
 		 432 aa  363  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  47.41 
 
 		 438 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  47.41 
 
 		 441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4171  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  49.5 
 
 		 433 aa  359  4e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  44.5 
 
 		 434 aa  358  8e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  50.66 
 
 		 442 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1718  manganese transport protein MntH  45.91 
 
 		 431 aa  349  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  45.91 
 
 		 431 aa  349  5e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  45.91 
 
 		 431 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  45.91 
 
 		 431 aa  349  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  45.66 
 
 		 431 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  49.31 
 
 		 445 aa  345  8e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1258  manganese/iron transporter  51.42 
 
 		 431 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1068  manganese/iron transporter  51.42 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.028316  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0230  manganese/iron transporter  51.42 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0502  manganese/iron transporter  51.42 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1414  manganese/iron transporter  51.42 
 
 		 437 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2576  manganese/iron transporter  51.42 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.202281  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1332  manganese/iron transporter  51.42 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1425  manganese/iron transporter  47.87 
 
 		 449 aa  342  9e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  48.72 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1050  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  48.17 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0099  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.04 
 
 		 431 aa  317  3e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.510784  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  43.31 
 
 		 622 aa  314  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1822  Mn2+/Fe2+ transporter  44.25 
 
 		 407 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  44.58 
 
 		 429 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4747  Mn2+/Fe2+ transporter  45.54 
 
 		 408 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0222  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  43.98 
 
 		 439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.46 
 
 		 450 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4366  manganese transporter NRAMP  45.3 
 
 		 408 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4453  Mn2+/Fe2+ transporter  45.3 
 
 		 408 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.0620923 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  44.78 
 
 		 401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  43.83 
 
 		 413 aa  299  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  43.58 
 
 		 448 aa  299  6e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  41.62 
 
 		 450 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  41.32 
 
 		 462 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0654  manganese transport protein MntH  47.79 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0327142  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3070  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  45.43 
 
 		 416 aa  293  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  42.12 
 
 		 453 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  43.14 
 
 		 463 aa  291  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0449  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  44.75 
 
 		 418 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  39.09 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  40.59 
 
 		 463 aa  290  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  40.44 
 
 		 425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  43.51 
 
 		 418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.42 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  41.83 
 
 		 445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  41.93 
 
 		 460 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  39.71 
 
 		 426 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  39.9 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  40.44 
 
 		 447 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  38.26 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  38.26 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  38.26 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  38.93 
 
 		 442 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  39.41 
 
 		 438 aa  279  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>