More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3704 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  100 
 
 		 438 aa  868    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  82.88 
 
 		 437 aa  719    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  82.88 
 
 		 437 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  82.88 
 
 		 437 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  94.29 
 
 		 438 aa  820    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  83.11 
 
 		 452 aa  703    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  94.75 
 
 		 438 aa  825    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  98.72 
 
 		 391 aa  759    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  94.75 
 
 		 438 aa  825    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  82.88 
 
 		 437 aa  719    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  82.88 
 
 		 437 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  94.75 
 
 		 438 aa  825    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  91.78 
 
 		 438 aa  776    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  61.02 
 
 		 442 aa  495  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  59.86 
 
 		 454 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  60.14 
 
 		 442 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  59.68 
 
 		 442 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  58.8 
 
 		 442 aa  471  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  58.24 
 
 		 445 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  58.93 
 
 		 439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  59.9 
 
 		 418 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  60.32 
 
 		 441 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2499  manganese transport protein MntH  58.06 
 
 		 410 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.645994  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  49.64 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  50.49 
 
 		 435 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  49.62 
 
 		 453 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  47.29 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  48.72 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.88 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.61 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  48.5 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  48.6 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  46.43 
 
 		 622 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  46.6 
 
 		 456 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  48.98 
 
 		 447 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  47.14 
 
 		 462 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  47.8 
 
 		 444 aa  354  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  46.98 
 
 		 450 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  47.98 
 
 		 460 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  48.07 
 
 		 463 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  47.88 
 
 		 448 aa  351  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  45.45 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.77 
 
 		 443 aa  351  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  45.71 
 
 		 446 aa  346  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  45.71 
 
 		 446 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  47.94 
 
 		 464 aa  345  8e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  46.58 
 
 		 450 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.12 
 
 		 448 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.63 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  45.94 
 
 		 627 aa  343  5e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  44.63 
 
 		 456 aa  339  5e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  47.75 
 
 		 441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  44.52 
 
 		 456 aa  338  9e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1912  manganese transport protein MntH  46.57 
 
 		 460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.38 
 
 		 625 aa  335  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3226  Mn2+/Fe2+ transporter  45.32 
 
 		 473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  40.52 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  40.52 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0302  manganese transport protein MntH  46.91 
 
 		 452 aa  322  7e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0831169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  43.8 
 
 		 448 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0331  manganese transport protein MntH  46.24 
 
 		 458 aa  320  3e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.243423  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.56 
 
 		 448 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  41.69 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1949  Mn2+/Fe2+ transporter  50.13 
 
 		 448 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344744  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53800  manganese transport protein MntH  48.36 
 
 		 438 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0707822  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0339  manganese transporter NRAMP  42.79 
 
 		 464 aa  315  9.999999999999999e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00143426  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2310  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.99 
 
 		 433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0246  manganese transport protein MntH  42.25 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1789  Mn2+/Fe2+ transporter  50.67 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0106  Mn2+/Fe2+ transporter  50.67 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2124  manganese/iron transporter  50.4 
 
 		 435 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2180  manganese/iron transporter  50.4 
 
 		 435 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122335  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2311  manganese transport protein  50.4 
 
 		 435 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  42.07 
 
 		 444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1280  Mn2+/Fe2+ transporter  46.73 
 
 		 448 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.547959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0745  Mn2+/Fe2+ transporter  42.36 
 
 		 446 aa  306  5.0000000000000004e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.429153  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D30  manganese transporter NRAMP  40.6 
 
 		 525 aa  297  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000755311  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  42.25 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2275  manganese/iron transporter  50.67 
 
 		 520 aa  293  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626373  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1861  Mn2+/Fe2+ transporter  38.86 
 
 		 530 aa  286  4e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.22 
 
 		 439 aa  286  7e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0311  Mn2+/Fe2+ transporter  39.31 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  41.21 
 
 		 434 aa  284  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1555  Mn2+/Fe2+ transporter  36.77 
 
 		 434 aa  282  7.000000000000001e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000268932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  38.85 
 
 		 412 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1795  manganese transporter NRAMP  38.53 
 
 		 532 aa  280  3e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  38.63 
 
 		 412 aa  279  8e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2025  Mn2+/Fe2+ transporter  40.24 
 
 		 522 aa  278  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1183  manganese transporter NRAMP  39.39 
 
 		 473 aa  277  3e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27409  Nramp family transporter: metal ion  39.75 
 
 		 489 aa  277  3e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.112546 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  39.66 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  39.66 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  39.66 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  39.66 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  39.66 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  39.66 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  40.1 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  38.61 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  38.61 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  38.61 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>