275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2310 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2310  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  100 
 
 
433 aa  846    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1949  Mn2+/Fe2+ transporter  95.62 
 
 
448 aa  744    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344744  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1280  Mn2+/Fe2+ transporter  76.44 
 
 
448 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.547959 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3226  Mn2+/Fe2+ transporter  71.57 
 
 
473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2311  manganese transport protein  75.12 
 
 
435 aa  535  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1789  Mn2+/Fe2+ transporter  75.12 
 
 
435 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0106  Mn2+/Fe2+ transporter  75.12 
 
 
435 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2124  manganese/iron transporter  75.37 
 
 
435 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2180  manganese/iron transporter  75.12 
 
 
435 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2275  manganese/iron transporter  72.85 
 
 
520 aa  531  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626373  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  51 
 
 
435 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  50.37 
 
 
444 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  50.5 
 
 
444 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  50.25 
 
 
451 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  48.77 
 
 
429 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  47.85 
 
 
426 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  48.13 
 
 
450 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  50.12 
 
 
448 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  51.97 
 
 
463 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  49.75 
 
 
453 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  49.52 
 
 
444 aa  362  8e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  51.85 
 
 
442 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  47.31 
 
 
463 aa  360  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  46.88 
 
 
622 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  49.61 
 
 
450 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  48.07 
 
 
456 aa  358  9e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  48.54 
 
 
447 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  51.11 
 
 
441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  48.45 
 
 
450 aa  355  6.999999999999999e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  46.96 
 
 
462 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  48.16 
 
 
454 aa  353  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  49.76 
 
 
442 aa  351  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  51.04 
 
 
442 aa  351  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  45.67 
 
 
456 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  48.79 
 
 
460 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  49.63 
 
 
444 aa  345  8e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  48.16 
 
 
456 aa  344  1e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1912  manganese transport protein MntH  48.32 
 
 
460 aa  345  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  47.91 
 
 
445 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  48.51 
 
 
438 aa  344  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  48.8 
 
 
464 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  48.65 
 
 
442 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  50.13 
 
 
446 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  50.13 
 
 
446 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  50 
 
 
438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  50 
 
 
438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  50 
 
 
438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  52.97 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  49.09 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  49.09 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  49.09 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  49.09 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  49.09 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  48.26 
 
 
438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  48.09 
 
 
463 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  48.89 
 
 
443 aa  335  7e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  50.75 
 
 
439 aa  332  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  46.9 
 
 
448 aa  331  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2499  manganese transport protein MntH  50 
 
 
410 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.645994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  47.98 
 
 
452 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  48.49 
 
 
438 aa  323  4e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.63 
 
 
448 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  49.58 
 
 
391 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0331  manganese transport protein MntH  48.92 
 
 
458 aa  316  5e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.243423  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  50.63 
 
 
441 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  40.37 
 
 
450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  40.37 
 
 
450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0302  manganese transport protein MntH  46.77 
 
 
452 aa  311  1e-83  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0831169  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  42.51 
 
 
453 aa  306  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.15 
 
 
625 aa  306  6e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  40.29 
 
 
448 aa  305  8.000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53800  manganese transport protein MntH  49.88 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0707822  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0246  manganese transport protein MntH  40.96 
 
 
444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  44.36 
 
 
627 aa  286  4e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0339  manganese transporter NRAMP  41.26 
 
 
464 aa  285  1.0000000000000001e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00143426  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  42.64 
 
 
444 aa  276  7e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  43.43 
 
 
442 aa  275  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D30  manganese transporter NRAMP  38.63 
 
 
525 aa  275  2.0000000000000002e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000755311  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1183  manganese transporter NRAMP  39.38 
 
 
473 aa  273  4.0000000000000004e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1861  Mn2+/Fe2+ transporter  39.05 
 
 
530 aa  272  8.000000000000001e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0745  Mn2+/Fe2+ transporter  41.06 
 
 
446 aa  271  2e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.429153  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  41 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  41.75 
 
 
435 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1795  manganese transporter NRAMP  38.63 
 
 
532 aa  268  1e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  41 
 
 
432 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0311  Mn2+/Fe2+ transporter  38.88 
 
 
449 aa  267  4e-70  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  40.25 
 
 
434 aa  266  4e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2025  Mn2+/Fe2+ transporter  36.68 
 
 
522 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  39.15 
 
 
441 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  39.6 
 
 
436 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  39.6 
 
 
436 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  42.12 
 
 
411 aa  261  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  39.6 
 
 
436 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  40.35 
 
 
430 aa  260  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  39.6 
 
 
438 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  43.01 
 
 
412 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  42.37 
 
 
412 aa  258  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.42 
 
 
432 aa  257  3e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  39.85 
 
 
425 aa  256  6e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  40.11 
 
 
423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>