More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2292 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  79.68 
 
 
444 aa  677    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  74.27 
 
 
444 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  100 
 
 
443 aa  867    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  73.81 
 
 
451 aa  638    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  73.36 
 
 
444 aa  633  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0302  manganese transport protein MntH  77.85 
 
 
452 aa  619  1e-176  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0831169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  75.11 
 
 
444 aa  617  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  74.31 
 
 
441 aa  608  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0331  manganese transport protein MntH  76.48 
 
 
458 aa  607  9.999999999999999e-173  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.243423  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  69.57 
 
 
453 aa  584  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1912  manganese transport protein MntH  69.23 
 
 
460 aa  578  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  70.74 
 
 
464 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  68.21 
 
 
450 aa  557  1e-157  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  63.89 
 
 
463 aa  552  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  69.16 
 
 
463 aa  541  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  57.11 
 
 
450 aa  501  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  62.01 
 
 
429 aa  494  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  60.75 
 
 
456 aa  485  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  60.28 
 
 
456 aa  483  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  61.45 
 
 
446 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  60.42 
 
 
447 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  58.55 
 
 
462 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  60.75 
 
 
446 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  58.41 
 
 
448 aa  478  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  59.11 
 
 
450 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53800  manganese transport protein MntH  64.84 
 
 
438 aa  475  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0707822  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  57.6 
 
 
460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  55.79 
 
 
426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  56.37 
 
 
622 aa  468  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  59.77 
 
 
448 aa  458  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  56.52 
 
 
463 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  55.05 
 
 
456 aa  453  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  58.78 
 
 
448 aa  437  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  55.5 
 
 
435 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  53.47 
 
 
627 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  52.17 
 
 
442 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  47.51 
 
 
450 aa  411  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  47.51 
 
 
450 aa  411  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  57.21 
 
 
625 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  50.91 
 
 
442 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  46.21 
 
 
453 aa  398  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  50.7 
 
 
454 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  50 
 
 
442 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  50.23 
 
 
442 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  47.37 
 
 
438 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3226  Mn2+/Fe2+ transporter  49.28 
 
 
473 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  50.25 
 
 
448 aa  386  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  47.24 
 
 
438 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  47.24 
 
 
438 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  47.24 
 
 
438 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  46.95 
 
 
444 aa  381  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  46.77 
 
 
438 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  49.52 
 
 
418 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  47.37 
 
 
438 aa  371  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  50.23 
 
 
445 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0339  manganese transporter NRAMP  46.31 
 
 
464 aa  372  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00143426  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D30  manganese transporter NRAMP  45.58 
 
 
525 aa  368  1e-100  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000755311  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  46.03 
 
 
437 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  46.03 
 
 
437 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  46.03 
 
 
437 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  46.03 
 
 
437 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  46.03 
 
 
437 aa  364  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  49.31 
 
 
439 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0246  manganese transport protein MntH  45.11 
 
 
444 aa  361  1e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2499  manganese transport protein MntH  50.25 
 
 
410 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.645994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  49.07 
 
 
441 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  48.6 
 
 
391 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0745  Mn2+/Fe2+ transporter  46.33 
 
 
446 aa  352  1e-95  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.429153  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1280  Mn2+/Fe2+ transporter  49.75 
 
 
448 aa  350  4e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.547959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  48.66 
 
 
452 aa  348  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2025  Mn2+/Fe2+ transporter  43.58 
 
 
522 aa  347  3e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1795  manganese transporter NRAMP  44.47 
 
 
532 aa  340  2e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0311  Mn2+/Fe2+ transporter  45.7 
 
 
449 aa  338  8e-92  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1555  Mn2+/Fe2+ transporter  42.49 
 
 
434 aa  335  7e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000268932  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1949  Mn2+/Fe2+ transporter  49.14 
 
 
448 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344744  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1183  manganese transporter NRAMP  45.5 
 
 
473 aa  332  9e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1861  Mn2+/Fe2+ transporter  42.57 
 
 
530 aa  330  2e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  44.17 
 
 
431 aa  330  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  44.62 
 
 
431 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  44.62 
 
 
431 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  46.15 
 
 
442 aa  328  8e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  44.17 
 
 
431 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  44.17 
 
 
431 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2310  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  48.89 
 
 
433 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2180  manganese/iron transporter  49.6 
 
 
435 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2124  manganese/iron transporter  49.6 
 
 
435 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2311  manganese transport protein  49.6 
 
 
435 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1789  Mn2+/Fe2+ transporter  49.6 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0106  Mn2+/Fe2+ transporter  49.6 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  44.36 
 
 
439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.4 
 
 
432 aa  313  4.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  44.74 
 
 
430 aa  311  1e-83  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  44.17 
 
 
431 aa  310  5e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  43.26 
 
 
432 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  43.95 
 
 
431 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  43.95 
 
 
431 aa  308  9e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1718  manganese transport protein MntH  43.95 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  46.38 
 
 
425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  42.95 
 
 
431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  43.72 
 
 
431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>