253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1555 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1555  Mn2+/Fe2+ transporter  100 
 
 
434 aa  867    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000268932  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  49.43 
 
 
444 aa  432  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  46.67 
 
 
450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  46.67 
 
 
450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0246  manganese transport protein MntH  47.44 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  45.98 
 
 
453 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0745  Mn2+/Fe2+ transporter  47.7 
 
 
446 aa  402  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.429153  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0339  manganese transporter NRAMP  46.01 
 
 
464 aa  402  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00143426  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0311  Mn2+/Fe2+ transporter  44.06 
 
 
449 aa  355  1e-96  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1861  Mn2+/Fe2+ transporter  43.78 
 
 
530 aa  352  5.9999999999999994e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  44.47 
 
 
463 aa  347  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1795  manganese transporter NRAMP  43.93 
 
 
532 aa  347  3e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D30  manganese transporter NRAMP  41.11 
 
 
525 aa  342  9e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000755311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  41.97 
 
 
426 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1183  manganese transporter NRAMP  44.6 
 
 
473 aa  342  1e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  45.81 
 
 
456 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  43.22 
 
 
450 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2025  Mn2+/Fe2+ transporter  43.62 
 
 
522 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  46.14 
 
 
450 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  43.93 
 
 
462 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  44.5 
 
 
429 aa  330  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  43.71 
 
 
451 aa  330  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  43.48 
 
 
444 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  40.05 
 
 
453 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  43.32 
 
 
444 aa  326  6e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  44.88 
 
 
456 aa  325  7e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.76 
 
 
448 aa  324  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  44.82 
 
 
460 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  42.01 
 
 
446 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  41.78 
 
 
446 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  41.53 
 
 
444 aa  318  9e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  43.12 
 
 
447 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  42.51 
 
 
463 aa  315  9e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.49 
 
 
443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  42.76 
 
 
441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  42.58 
 
 
435 aa  306  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  41.07 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  41.67 
 
 
448 aa  303  5.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  41.57 
 
 
450 aa  303  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  40.46 
 
 
464 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  40.41 
 
 
456 aa  299  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1912  manganese transport protein MntH  39.82 
 
 
460 aa  298  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.22 
 
 
448 aa  298  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.79 
 
 
444 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  40.28 
 
 
622 aa  292  1e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  36.77 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  36.77 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  36.77 
 
 
438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  36.77 
 
 
438 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  36.77 
 
 
438 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  37 
 
 
438 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  37.88 
 
 
445 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0331  manganese transport protein MntH  40.46 
 
 
458 aa  275  8e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.243423  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  36.19 
 
 
454 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  37.47 
 
 
442 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  39.17 
 
 
418 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0302  manganese transport protein MntH  40 
 
 
452 aa  273  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0831169  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  37.56 
 
 
437 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53800  manganese transport protein MntH  42.12 
 
 
438 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0707822  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  37.56 
 
 
437 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  37.56 
 
 
437 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  37.56 
 
 
437 aa  273  6e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  37.56 
 
 
437 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  36.95 
 
 
442 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.16 
 
 
627 aa  270  5e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  37.18 
 
 
442 aa  269  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  36.89 
 
 
442 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  37.97 
 
 
439 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  36.68 
 
 
452 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2499  manganese transport protein MntH  37.96 
 
 
410 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.645994  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  37.14 
 
 
448 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  38.23 
 
 
441 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3226  Mn2+/Fe2+ transporter  36.76 
 
 
473 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  36.48 
 
 
391 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.14 
 
 
625 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  37.02 
 
 
431 aa  245  9e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  37.02 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  37.02 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  36.87 
 
 
431 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  36.54 
 
 
431 aa  240  4e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  36.59 
 
 
432 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1280  Mn2+/Fe2+ transporter  40.21 
 
 
448 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.547959 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2311  manganese transport protein  40.62 
 
 
435 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  37.47 
 
 
425 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1789  Mn2+/Fe2+ transporter  40.62 
 
 
435 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0106  Mn2+/Fe2+ transporter  40.62 
 
 
435 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2124  manganese/iron transporter  40.62 
 
 
435 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2180  manganese/iron transporter  40.62 
 
 
435 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2310  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  39.9 
 
 
433 aa  236  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1949  Mn2+/Fe2+ transporter  39.02 
 
 
448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344744  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  36.78 
 
 
431 aa  226  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  36.78 
 
 
431 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  36.78 
 
 
431 aa  225  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1718  manganese transport protein MntH  36.54 
 
 
431 aa  224  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4171  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  37.98 
 
 
433 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248736  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2275  manganese/iron transporter  38.5 
 
 
520 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626373  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  34.22 
 
 
442 aa  223  7e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  36.54 
 
 
431 aa  222  9e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  36.03 
 
 
431 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  35.97 
 
 
439 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>