More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1141 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  100 
 
 		 425 aa  848    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  46.3 
 
 		 454 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  46.06 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  46.78 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  45.48 
 
 		 442 aa  318  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  46.29 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  42.75 
 
 		 456 aa  315  9.999999999999999e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  45.21 
 
 		 435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  44.25 
 
 		 463 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  45.48 
 
 		 448 aa  311  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.06 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  46.78 
 
 		 456 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  47.63 
 
 		 445 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  46.25 
 
 		 434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  46.53 
 
 		 456 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  47.22 
 
 		 418 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  44.84 
 
 		 411 aa  306  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  40.93 
 
 		 434 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  45.55 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  46.06 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  43.54 
 
 		 413 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  43.54 
 
 		 392 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  43.54 
 
 		 392 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  43.54 
 
 		 392 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  43.54 
 
 		 392 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  44.76 
 
 		 447 aa  302  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  44.88 
 
 		 442 aa  302  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  45.79 
 
 		 450 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  43.04 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  43.04 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  43.04 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  43.04 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  43.04 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  43.31 
 
 		 462 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  43.04 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  43.04 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  43.04 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  43.04 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  46.17 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  43.94 
 
 		 448 aa  299  8e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  43.29 
 
 		 412 aa  298  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  46.23 
 
 		 439 aa  297  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  42.25 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  44.77 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  44.74 
 
 		 460 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  42.03 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  42.47 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  42.47 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  42.47 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  44.5 
 
 		 622 aa  293  3e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  42.39 
 
 		 437 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  42.39 
 
 		 437 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  42.39 
 
 		 437 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  42.39 
 
 		 437 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  42.39 
 
 		 437 aa  292  6e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  41.75 
 
 		 438 aa  292  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  41.02 
 
 		 438 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  41.02 
 
 		 438 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  41.02 
 
 		 438 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  41.3 
 
 		 414 aa  290  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  42.47 
 
 		 435 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  42.47 
 
 		 438 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  48.4 
 
 		 444 aa  289  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  45.26 
 
 		 627 aa  289  8e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  42.22 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  45.8 
 
 		 442 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2499  manganese transport protein MntH  45.76 
 
 		 410 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.645994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  47.45 
 
 		 441 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  39.62 
 
 		 450 aa  286  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  39.62 
 
 		 450 aa  286  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.28 
 
 		 448 aa  285  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42 
 
 		 432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  44.44 
 
 		 453 aa  282  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  43.94 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  45.3 
 
 		 451 aa  280  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  45.05 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  44.55 
 
 		 444 aa  279  8e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.35 
 
 		 420 aa  279  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  42 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  45.5 
 
 		 625 aa  277  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.38 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  40.44 
 
 		 409 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  40.44 
 
 		 409 aa  276  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  41.24 
 
 		 391 aa  276  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  42.14 
 
 		 438 aa  276  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  39.67 
 
 		 453 aa  276  7e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  42.09 
 
 		 432 aa  276  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  41.15 
 
 		 452 aa  276  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  42 
 
 		 446 aa  275  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  41.67 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  43.8 
 
 		 445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  43.8 
 
 		 448 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  43.84 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  41.41 
 
 		 411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  43.98 
 
 		 433 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1414  manganese/iron transporter  45.43 
 
 		 437 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1068  manganese/iron transporter  45.43 
 
 		 437 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.028316  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0230  manganese/iron transporter  45.43 
 
 		 437 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0502  manganese/iron transporter  45.43 
 
 		 437 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>