More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1894 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 		 414 aa  821    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  45.05 
 
 		 414 aa  354  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  42.56 
 
 		 417 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  41.78 
 
 		 427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  43.67 
 
 		 441 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  40 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  41.84 
 
 		 429 aa  300  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  41.3 
 
 		 425 aa  297  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  41.55 
 
 		 439 aa  297  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  42.08 
 
 		 456 aa  288  9e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  36.54 
 
 		 434 aa  288  9e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  39.62 
 
 		 462 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  41.33 
 
 		 456 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  37.99 
 
 		 463 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  40.1 
 
 		 431 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  40.25 
 
 		 432 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  39.61 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.01 
 
 		 432 aa  277  2e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.35 
 
 		 450 aa  277  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  39.61 
 
 		 431 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  39.61 
 
 		 431 aa  276  5e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  39.61 
 
 		 431 aa  276  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  41.51 
 
 		 447 aa  275  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  41.84 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  37.96 
 
 		 434 aa  273  6e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.75 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  39.79 
 
 		 453 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  40 
 
 		 460 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2183  manganese transporter NRAMP  45.43 
 
 		 326 aa  267  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0049052  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  37.62 
 
 		 438 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  38.11 
 
 		 439 aa  265  8.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  37.62 
 
 		 441 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  40.29 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  38.76 
 
 		 442 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  39.85 
 
 		 431 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  37.44 
 
 		 435 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  36.76 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  39.61 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  39.85 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  39.61 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  36.76 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.44 
 
 		 448 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  36.76 
 
 		 436 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  40.64 
 
 		 411 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1718  manganese transport protein MntH  39.61 
 
 		 431 aa  259  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4171  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  40 
 
 		 433 aa  259  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  40.05 
 
 		 448 aa  259  8e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.63 
 
 		 444 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  39.37 
 
 		 448 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  38.28 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  39.31 
 
 		 412 aa  256  7e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  39.8 
 
 		 423 aa  256  7e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  39.07 
 
 		 412 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  39.07 
 
 		 412 aa  255  9e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  39.07 
 
 		 412 aa  255  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  39.07 
 
 		 413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  39.28 
 
 		 463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  36.3 
 
 		 622 aa  255  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  41.22 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  37.8 
 
 		 446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.82 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  38.82 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  38.82 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  38.82 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  38.82 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  38.82 
 
 		 412 aa  253  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  38.44 
 
 		 451 aa  253  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  39.15 
 
 		 392 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  37.5 
 
 		 444 aa  252  8.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.2 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  39.15 
 
 		 392 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  39.15 
 
 		 392 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  40.53 
 
 		 444 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  39.15 
 
 		 392 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  38.46 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  38.57 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  37.2 
 
 		 439 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  39.07 
 
 		 412 aa  250  3e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  36.08 
 
 		 426 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  40.05 
 
 		 441 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.83 
 
 		 443 aa  249  8e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  37.77 
 
 		 442 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  38.82 
 
 		 412 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  39.31 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  39.51 
 
 		 463 aa  247  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  38.39 
 
 		 410 aa  246  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  40.53 
 
 		 418 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  36.52 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  40.22 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  37.47 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  37.47 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  37.47 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  38.1 
 
 		 409 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  38.1 
 
 		 409 aa  244  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  37.78 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1815  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  36.65 
 
 		 409 aa  241  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  37.72 
 
 		 448 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  39.95 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  37.32 
 
 		 413 aa  242  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  37.7 
 
 		 438 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>