More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2183 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2183  manganese transporter NRAMP  100 
 
 
326 aa  648    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0049052  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  61.85 
 
 
427 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  59.88 
 
 
414 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  60 
 
 
441 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  54.57 
 
 
417 aa  359  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  55.31 
 
 
404 aa  352  5e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  45.43 
 
 
414 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  38.56 
 
 
425 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  37.7 
 
 
463 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  36.07 
 
 
438 aa  187  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  34.15 
 
 
434 aa  186  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  38.78 
 
 
435 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  35.78 
 
 
429 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  35.37 
 
 
438 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  35.37 
 
 
438 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  35.37 
 
 
438 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  34.38 
 
 
432 aa  182  9.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  36.48 
 
 
448 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  39.41 
 
 
444 aa  180  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  39.74 
 
 
451 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  35.31 
 
 
434 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  37.13 
 
 
442 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  38.46 
 
 
463 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  34.29 
 
 
438 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.76 
 
 
444 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  34.37 
 
 
441 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  36.91 
 
 
426 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  37.86 
 
 
454 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  35.53 
 
 
442 aa  175  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  34.26 
 
 
436 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  37.18 
 
 
627 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  34.26 
 
 
436 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  34.06 
 
 
438 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  34.26 
 
 
436 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  34.67 
 
 
435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  34.15 
 
 
622 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  34.63 
 
 
453 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  37.34 
 
 
456 aa  172  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  33.11 
 
 
437 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  33.11 
 
 
437 aa  173  5e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  37.01 
 
 
456 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  33.11 
 
 
437 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  33.11 
 
 
437 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  33.11 
 
 
437 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1425  manganese/iron transporter  34.06 
 
 
449 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  36 
 
 
439 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  35.62 
 
 
450 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1068  manganese/iron transporter  34.06 
 
 
437 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.028316  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0230  manganese/iron transporter  34.06 
 
 
437 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0502  manganese/iron transporter  34.06 
 
 
437 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1258  manganese/iron transporter  34.06 
 
 
431 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  37.46 
 
 
444 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  36.89 
 
 
442 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  32.82 
 
 
439 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  38.11 
 
 
441 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  35.28 
 
 
438 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1332  manganese/iron transporter  33.75 
 
 
437 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2576  manganese/iron transporter  33.75 
 
 
449 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.202281  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1414  manganese/iron transporter  33.75 
 
 
437 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  35.57 
 
 
391 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  37.07 
 
 
445 aa  169  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  35.37 
 
 
460 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  36.16 
 
 
442 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  37.42 
 
 
448 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  35.37 
 
 
447 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  37.79 
 
 
418 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  36.98 
 
 
442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  35.69 
 
 
462 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  37.33 
 
 
448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  31.65 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  31.65 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  34.6 
 
 
442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.66 
 
 
444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0302  manganese transport protein MntH  35.65 
 
 
452 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0831169  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  33.23 
 
 
456 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  33.44 
 
 
432 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  33.44 
 
 
452 aa  162  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0331  manganese transport protein MntH  36.22 
 
 
458 aa  162  6e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.243423  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  35.6 
 
 
450 aa  162  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  36.01 
 
 
433 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  33.55 
 
 
450 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  38.29 
 
 
441 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  37.86 
 
 
463 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  37.17 
 
 
431 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  37.17 
 
 
431 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  37.17 
 
 
431 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  37.17 
 
 
431 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.27 
 
 
443 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  38.39 
 
 
439 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  36.84 
 
 
431 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  30.82 
 
 
453 aa  155  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  32.89 
 
 
413 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  37.46 
 
 
625 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  36.51 
 
 
432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  36.69 
 
 
446 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  34.06 
 
 
423 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  36.36 
 
 
446 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  33.33 
 
 
439 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1555  Mn2+/Fe2+ transporter  30.12 
 
 
434 aa  150  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000268932  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0222  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  32.28 
 
 
439 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>