More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4475 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1258  manganese/iron transporter  78.29 
 
 
431 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2576  manganese/iron transporter  78.29 
 
 
449 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.202281  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  90.64 
 
 
435 aa  784    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1425  manganese/iron transporter  78.52 
 
 
449 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1068  manganese/iron transporter  78.29 
 
 
437 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.028316  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  91.34 
 
 
436 aa  786    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  98.41 
 
 
441 aa  853    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  100 
 
 
438 aa  867    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  91.34 
 
 
436 aa  786    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  91.34 
 
 
436 aa  786    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1332  manganese/iron transporter  78.29 
 
 
437 aa  634    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1414  manganese/iron transporter  78.52 
 
 
437 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0230  manganese/iron transporter  78.29 
 
 
437 aa  636    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0502  manganese/iron transporter  78.29 
 
 
437 aa  636    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  64.69 
 
 
439 aa  515  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  60.24 
 
 
434 aa  495  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  61.63 
 
 
432 aa  484  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  58.67 
 
 
439 aa  487  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1050  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  66.49 
 
 
441 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  60.81 
 
 
445 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  64.43 
 
 
442 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  59.86 
 
 
433 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  52.22 
 
 
432 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  51.97 
 
 
442 aa  415  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  49.06 
 
 
439 aa  396  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  50.12 
 
 
420 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  50.89 
 
 
411 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  48.2 
 
 
430 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  47.41 
 
 
409 aa  355  8.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  47.41 
 
 
409 aa  355  8.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  48.04 
 
 
412 aa  352  7e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  48.04 
 
 
412 aa  352  7e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  47.25 
 
 
411 aa  348  9e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  45.45 
 
 
412 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  45.45 
 
 
412 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  45.45 
 
 
412 aa  348  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  45.45 
 
 
412 aa  348  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  45.45 
 
 
413 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  45.45 
 
 
412 aa  348  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  45.45 
 
 
412 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  45.45 
 
 
412 aa  348  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  45.45 
 
 
412 aa  348  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  45.45 
 
 
412 aa  348  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  46 
 
 
412 aa  347  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  47.29 
 
 
392 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  47.99 
 
 
412 aa  345  7e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  47.29 
 
 
392 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  47.29 
 
 
392 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  47.29 
 
 
392 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  47.06 
 
 
410 aa  340  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  45.65 
 
 
431 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4171  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.65 
 
 
433 aa  336  5e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248736  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  47.31 
 
 
423 aa  332  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  38.97 
 
 
431 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  38.97 
 
 
431 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  38.97 
 
 
431 aa  316  6e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  38.97 
 
 
431 aa  316  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  40.79 
 
 
432 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.08 
 
 
450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0654  manganese transport protein MntH  47.78 
 
 
421 aa  313  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0327142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  38.5 
 
 
431 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  41 
 
 
434 aa  311  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  39.44 
 
 
431 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  39.2 
 
 
431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  39.2 
 
 
431 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1815  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  40.87 
 
 
409 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1718  manganese transport protein MntH  38.97 
 
 
431 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  38.97 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.61 
 
 
448 aa  296  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  41.53 
 
 
622 aa  294  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  42.13 
 
 
445 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.53 
 
 
463 aa  289  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  42.47 
 
 
425 aa  289  7e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  38.6 
 
 
429 aa  288  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  45.28 
 
 
441 aa  285  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  41.69 
 
 
426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  39.5 
 
 
453 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  43.78 
 
 
442 aa  280  3e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  39.82 
 
 
454 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  40.73 
 
 
442 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  40.4 
 
 
463 aa  277  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  39.75 
 
 
448 aa  277  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.47 
 
 
444 aa  276  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  39.58 
 
 
442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  36.59 
 
 
450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  36.59 
 
 
450 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  42.43 
 
 
463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  40 
 
 
456 aa  274  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  43.14 
 
 
444 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  42.9 
 
 
418 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  39.63 
 
 
437 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  43.1 
 
 
625 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  41.98 
 
 
451 aa  269  8e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  42.07 
 
 
456 aa  269  8e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  39.34 
 
 
456 aa  269  8.999999999999999e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  39.4 
 
 
437 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  40.65 
 
 
462 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  39.4 
 
 
437 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  39.4 
 
 
437 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  39.4 
 
 
437 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>