More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3889 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  96.85 
 
 		 444 aa  820    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  99.32 
 
 		 451 aa  857    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  79.17 
 
 		 444 aa  656    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  81.34 
 
 		 441 aa  655    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  81.34 
 
 		 444 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  100 
 
 		 444 aa  863    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  76.67 
 
 		 464 aa  615  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  73.36 
 
 		 443 aa  615  1e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1912  manganese transport protein MntH  75.75 
 
 		 460 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  70.02 
 
 		 453 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  71.4 
 
 		 450 aa  585  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  69.19 
 
 		 463 aa  578  1e-164  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0302  manganese transport protein MntH  72.31 
 
 		 452 aa  574  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0831169  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0331  manganese transport protein MntH  71.17 
 
 		 458 aa  564  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.243423  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  70.21 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  61.66 
 
 		 446 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  59.81 
 
 		 426 aa  497  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  61.43 
 
 		 446 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  56.49 
 
 		 450 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  59.15 
 
 		 429 aa  491  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  58.54 
 
 		 462 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  61.08 
 
 		 447 aa  488  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  59.48 
 
 		 460 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  59.63 
 
 		 448 aa  487  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  58.33 
 
 		 450 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  59.91 
 
 		 456 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53800  manganese transport protein MntH  67.51 
 
 		 438 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0707822  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  59.67 
 
 		 456 aa  477  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  60.61 
 
 		 448 aa  473  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  57.27 
 
 		 456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  56.64 
 
 		 622 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  56.37 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  58.17 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  56.61 
 
 		 448 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  48.78 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  48.78 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  47.31 
 
 		 453 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3226  Mn2+/Fe2+ transporter  50.49 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  52.08 
 
 		 442 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  53.77 
 
 		 625 aa  395  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  52.61 
 
 		 627 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  52.55 
 
 		 418 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  48.63 
 
 		 454 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  48.95 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  48.95 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  48.97 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  48.95 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  51.7 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  48.72 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  51.74 
 
 		 448 aa  388  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  48.52 
 
 		 442 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  48.72 
 
 		 438 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  53.71 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0246  manganese transport protein MntH  47.84 
 
 		 444 aa  380  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  47.9 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  50.23 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  47.9 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  47.9 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  49.88 
 
 		 438 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0339  manganese transporter NRAMP  46.22 
 
 		 464 aa  378  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00143426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  47.9 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  47.9 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2499  manganese transport protein MntH  51 
 
 		 410 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.645994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  51.88 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1280  Mn2+/Fe2+ transporter  49.26 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.547959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  47.96 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  45.66 
 
 		 444 aa  364  2e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1949  Mn2+/Fe2+ transporter  51 
 
 		 448 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344744  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  49.61 
 
 		 391 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D30  manganese transporter NRAMP  46.46 
 
 		 525 aa  359  5e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000755311  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2310  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  50.5 
 
 		 433 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0311  Mn2+/Fe2+ transporter  44.92 
 
 		 449 aa  345  1e-93  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2025  Mn2+/Fe2+ transporter  42.83 
 
 		 522 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1555  Mn2+/Fe2+ transporter  43.48 
 
 		 434 aa  342  1e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000268932  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1795  manganese transporter NRAMP  44.87 
 
 		 532 aa  340  4e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0745  Mn2+/Fe2+ transporter  45.45 
 
 		 446 aa  338  9e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.429153  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2180  manganese/iron transporter  50 
 
 		 435 aa  336  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2124  manganese/iron transporter  50 
 
 		 435 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1861  Mn2+/Fe2+ transporter  43.9 
 
 		 530 aa  335  7e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1183  manganese transporter NRAMP  45.02 
 
 		 473 aa  334  2e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2311  manganese transport protein  49.74 
 
 		 435 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1789  Mn2+/Fe2+ transporter  49.74 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0106  Mn2+/Fe2+ transporter  49.74 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2275  manganese/iron transporter  49.61 
 
 		 520 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626373  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  46.1 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  43.03 
 
 		 431 aa  315  9e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  43.52 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  43.52 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  41.89 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  43.28 
 
 		 431 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  42.82 
 
 		 431 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  44.11 
 
 		 439 aa  308  9e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  42.95 
 
 		 434 aa  302  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27409  Nramp family transporter: metal ion  41.33 
 
 		 489 aa  301  2e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  45.38 
 
 		 439 aa  299  8e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  42.82 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  42.82 
 
 		 431 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  42.82 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1718  manganese transport protein MntH  42.58 
 
 		 431 aa  296  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  42.58 
 
 		 431 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>