More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0858 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  100 
 
 
413 aa  786    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  68.59 
 
 
401 aa  527  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0222  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  62.62 
 
 
439 aa  476  1e-133  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  59.06 
 
 
429 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1822  Mn2+/Fe2+ transporter  61.25 
 
 
407 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3070  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  65.16 
 
 
416 aa  442  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4747  Mn2+/Fe2+ transporter  59.22 
 
 
408 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4366  manganese transporter NRAMP  58.98 
 
 
408 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4453  Mn2+/Fe2+ transporter  58.98 
 
 
408 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.0620923 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0999  NRAMP family Mn2+ and Fe2+ transporter  59.55 
 
 
455 aa  434  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0224  natural resistance-associated macrophage protein  69.09 
 
 
402 aa  431  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0449  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  62.41 
 
 
418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3159  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  63.93 
 
 
412 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495949  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4171  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  53.19 
 
 
433 aa  371  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248736  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1815  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.17 
 
 
409 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  47.55 
 
 
439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  46.73 
 
 
431 aa  328  9e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  46.48 
 
 
431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.19 
 
 
430 aa  327  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  45.98 
 
 
431 aa  325  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  45.98 
 
 
431 aa  325  6e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  45.27 
 
 
442 aa  325  1e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  45.73 
 
 
431 aa  322  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  46.12 
 
 
432 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  44.19 
 
 
423 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0099  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  52.54 
 
 
431 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.510784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  42.79 
 
 
411 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  43.28 
 
 
412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  40.54 
 
 
432 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  43.28 
 
 
412 aa  302  7.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  45.48 
 
 
431 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  43.83 
 
 
409 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  43.83 
 
 
409 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  45.48 
 
 
431 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  45.48 
 
 
431 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  45.48 
 
 
431 aa  298  8e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  45.52 
 
 
411 aa  299  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1718  manganese transport protein MntH  45.23 
 
 
431 aa  297  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  44.67 
 
 
434 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  42.93 
 
 
410 aa  296  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  41.32 
 
 
412 aa  296  6e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  43.52 
 
 
431 aa  293  3e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  42.25 
 
 
412 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  42.25 
 
 
412 aa  293  4e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  42.25 
 
 
412 aa  293  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.34 
 
 
412 aa  293  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  45.36 
 
 
439 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  42.34 
 
 
412 aa  293  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  42.34 
 
 
412 aa  293  5e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  42.34 
 
 
412 aa  293  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  42.34 
 
 
412 aa  293  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  42.34 
 
 
412 aa  293  5e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  42.36 
 
 
412 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  44.2 
 
 
420 aa  289  6e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  41.97 
 
 
413 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  42.68 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  42.68 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  42.68 
 
 
392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  42.68 
 
 
392 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  40.81 
 
 
434 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  42.69 
 
 
439 aa  282  9e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  44.07 
 
 
445 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  42.35 
 
 
435 aa  277  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  44.76 
 
 
442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  41.84 
 
 
436 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  41.84 
 
 
436 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  41.84 
 
 
436 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  41.88 
 
 
432 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1332  manganese/iron transporter  45.15 
 
 
437 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2576  manganese/iron transporter  45.15 
 
 
449 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.202281  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  40.82 
 
 
441 aa  266  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1425  manganese/iron transporter  41.87 
 
 
449 aa  264  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1068  manganese/iron transporter  44.9 
 
 
437 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.028316  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0230  manganese/iron transporter  44.9 
 
 
437 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0502  manganese/iron transporter  44.9 
 
 
437 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1414  manganese/iron transporter  44.9 
 
 
437 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1258  manganese/iron transporter  44.9 
 
 
431 aa  263  4e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  40.31 
 
 
438 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  40.59 
 
 
438 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  40.59 
 
 
438 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  40.59 
 
 
438 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  40.4 
 
 
438 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0654  manganese transport protein MntH  48.98 
 
 
421 aa  255  9e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0327142  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  40.1 
 
 
463 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1050  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.93 
 
 
441 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  39.64 
 
 
437 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  39.64 
 
 
437 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  39.64 
 
 
437 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  39.35 
 
 
438 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  39.64 
 
 
437 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  39.64 
 
 
437 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  41.91 
 
 
444 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  39.66 
 
 
622 aa  249  6e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  37.32 
 
 
414 aa  249  7e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  37.83 
 
 
429 aa  249  7e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  42.42 
 
 
433 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  41.18 
 
 
451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  41.09 
 
 
444 aa  246  6e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  41.18 
 
 
444 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  39.71 
 
 
463 aa  244  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>