More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4410 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
435 aa  851    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  61.46 
 
 
463 aa  475  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  58.17 
 
 
444 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  57.91 
 
 
444 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  58.42 
 
 
451 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  54.96 
 
 
426 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  51.91 
 
 
450 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  57.18 
 
 
444 aa  428  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  60.79 
 
 
444 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  55.77 
 
 
448 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  53.83 
 
 
463 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  52.38 
 
 
429 aa  424  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  53.2 
 
 
622 aa  421  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  55.32 
 
 
450 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  53.57 
 
 
456 aa  421  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  55.27 
 
 
456 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  59.06 
 
 
441 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  53.25 
 
 
447 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  56.34 
 
 
443 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  52.62 
 
 
456 aa  413  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  52.54 
 
 
462 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  54.65 
 
 
625 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  53.09 
 
 
446 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  54.32 
 
 
453 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  53.33 
 
 
446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  53.15 
 
 
450 aa  404  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  51.35 
 
 
460 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  55.22 
 
 
463 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  49.77 
 
 
627 aa  401  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  55.58 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  48.71 
 
 
438 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  48.71 
 
 
438 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  48.71 
 
 
438 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  48.24 
 
 
438 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  53.16 
 
 
448 aa  397  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  53.19 
 
 
418 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  50.49 
 
 
438 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1912  manganese transport protein MntH  54.41 
 
 
460 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  50.49 
 
 
438 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0331  manganese transport protein MntH  57.04 
 
 
458 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.243423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  49.31 
 
 
442 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  52.71 
 
 
439 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0302  manganese transport protein MntH  56.79 
 
 
452 aa  382  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0831169  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  49.08 
 
 
442 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  50.82 
 
 
445 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2499  manganese transport protein MntH  51.6 
 
 
410 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.645994  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  46.54 
 
 
448 aa  376  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  50 
 
 
391 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  48.92 
 
 
442 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  49.25 
 
 
437 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  49.25 
 
 
437 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  49.25 
 
 
437 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  48.19 
 
 
454 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  49.25 
 
 
437 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  49.25 
 
 
437 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  51.06 
 
 
441 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  47.76 
 
 
442 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  52.36 
 
 
448 aa  366  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3226  Mn2+/Fe2+ transporter  47.28 
 
 
473 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0451347  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  46.23 
 
 
450 aa  365  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  46.65 
 
 
452 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  46.23 
 
 
450 aa  365  1e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  45.5 
 
 
453 aa  363  3e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53800  manganese transport protein MntH  56.18 
 
 
438 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0707822  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1949  Mn2+/Fe2+ transporter  50.73 
 
 
448 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344744  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2310  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  50.74 
 
 
433 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  44.84 
 
 
444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1280  Mn2+/Fe2+ transporter  50.12 
 
 
448 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.547959 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0339  manganese transporter NRAMP  44.89 
 
 
464 aa  349  6e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00143426  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0246  manganese transport protein MntH  43.14 
 
 
444 aa  334  2e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D30  manganese transporter NRAMP  42.36 
 
 
525 aa  330  3e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000755311  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2025  Mn2+/Fe2+ transporter  40.47 
 
 
522 aa  325  9e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  45.21 
 
 
425 aa  323  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2311  manganese transport protein  52.02 
 
 
435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0745  Mn2+/Fe2+ transporter  43.17 
 
 
446 aa  319  5e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.429153  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2124  manganese/iron transporter  51.75 
 
 
435 aa  319  7e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1789  Mn2+/Fe2+ transporter  51.75 
 
 
435 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0106  Mn2+/Fe2+ transporter  51.75 
 
 
435 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2180  manganese/iron transporter  51.48 
 
 
435 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122335  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1795  manganese transporter NRAMP  43.13 
 
 
532 aa  315  8e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1183  manganese transporter NRAMP  42.42 
 
 
473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1555  Mn2+/Fe2+ transporter  42.58 
 
 
434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000268932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1861  Mn2+/Fe2+ transporter  42.59 
 
 
530 aa  309  5.9999999999999995e-83  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2275  manganese/iron transporter  50.81 
 
 
520 aa  306  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626373  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  41.44 
 
 
439 aa  297  3e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  42.51 
 
 
411 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  41.73 
 
 
434 aa  293  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0311  Mn2+/Fe2+ transporter  41.02 
 
 
449 aa  290  3e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  40.19 
 
 
430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  38.29 
 
 
432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  39.06 
 
 
423 aa  281  2e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  38.71 
 
 
442 aa  280  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  42.4 
 
 
436 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  42.4 
 
 
436 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  42.4 
 
 
436 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  37.84 
 
 
431 aa  276  4e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  37.84 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  37.84 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  37.59 
 
 
431 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  41.63 
 
 
439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>