More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1584 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  100 
 
 		 453 aa  907    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2427  manganese transport protein MntH  74.55 
 
 		 450 aa  634  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1912  manganese transport protein MntH  76.2 
 
 		 460 aa  630  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2243  manganese transport protein MntH  76.35 
 
 		 464 aa  621  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.478916  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4273  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  70.98 
 
 		 444 aa  609  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.702031 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00917  manganese transport protein MntH  70.47 
 
 		 444 aa  607  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17439  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3597  Mn2+/Fe2+ transporter  70.02 
 
 		 451 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3889  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  70.02 
 
 		 444 aa  600  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1352  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  72.62 
 
 		 463 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6593  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  70.68 
 
 		 444 aa  585  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6058  Mn2+/Fe2+ transporter  69.32 
 
 		 441 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.165886  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2292  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  69.57 
 
 		 443 aa  577  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156307 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  65.25 
 
 		 463 aa  572  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  60.97 
 
 		 450 aa  531  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  59.48 
 
 		 429 aa  520  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0331  manganese transport protein MntH  65.5 
 
 		 458 aa  518  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.243423  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0302  manganese transport protein MntH  65.73 
 
 		 452 aa  520  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0831169  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  60.59 
 
 		 448 aa  514  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  59.39 
 
 		 426 aa  511  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  59.54 
 
 		 456 aa  509  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  58.06 
 
 		 456 aa  505  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  58.6 
 
 		 462 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0526  manganese transport protein MntH  58.2 
 
 		 446 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  60.32 
 
 		 447 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  54.91 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  57.98 
 
 		 446 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  59.57 
 
 		 622 aa  497  1e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  58.17 
 
 		 450 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  58.86 
 
 		 460 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  60.28 
 
 		 448 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53800  manganese transport protein MntH  62.86 
 
 		 438 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0707822  normal  0.201355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  57.24 
 
 		 448 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  55.66 
 
 		 627 aa  430  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  54.32 
 
 		 435 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  55.53 
 
 		 625 aa  425  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  50.46 
 
 		 450 aa  421  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  50.46 
 
 		 450 aa  421  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  52.43 
 
 		 463 aa  423  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  50.47 
 
 		 442 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  49.77 
 
 		 453 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5254  manganese transport protein MntH  51.67 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0236674  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3226  Mn2+/Fe2+ transporter  48.44 
 
 		 473 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0451347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  50.72 
 
 		 454 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  51.2 
 
 		 442 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  52.16 
 
 		 418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  48.82 
 
 		 442 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  51.72 
 
 		 448 aa  398  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  51.57 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  48.57 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0246  manganese transport protein MntH  47.86 
 
 		 444 aa  392  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  49.17 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  51.2 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  49.17 
 
 		 437 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  48.33 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  47.86 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  47.86 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  49.17 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  47.86 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  49.17 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  49.17 
 
 		 437 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2499  manganese transport protein MntH  51.97 
 
 		 410 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.645994  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  49.88 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1280  Mn2+/Fe2+ transporter  49.88 
 
 		 448 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.547959 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0339  manganese transporter NRAMP  46.2 
 
 		 464 aa  381  1e-104  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00143426  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  51.3 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  48.7 
 
 		 452 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0729  manganese transporter NRAMP  45.58 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1949  Mn2+/Fe2+ transporter  50.37 
 
 		 448 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.344744  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  48.97 
 
 		 391 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2180  manganese/iron transporter  49.5 
 
 		 435 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.122335  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2310  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  49.63 
 
 		 433 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.302297 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2124  manganese/iron transporter  49.26 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336422  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2311  manganese transport protein  49.01 
 
 		 435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1789  Mn2+/Fe2+ transporter  49.01 
 
 		 435 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0106  Mn2+/Fe2+ transporter  49.01 
 
 		 435 aa  352  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0745  Mn2+/Fe2+ transporter  46.26 
 
 		 446 aa  345  1e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.429153  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0311  Mn2+/Fe2+ transporter  44.19 
 
 		 449 aa  342  8e-93  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1555  Mn2+/Fe2+ transporter  40.05 
 
 		 434 aa  342  9e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000268932  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D30  manganese transporter NRAMP  44.39 
 
 		 525 aa  341  2e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000755311  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2025  Mn2+/Fe2+ transporter  43.39 
 
 		 522 aa  339  5e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2275  manganese/iron transporter  48.51 
 
 		 520 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626373  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  44.95 
 
 		 442 aa  333  5e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  44.63 
 
 		 431 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  44.28 
 
 		 431 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1795  manganese transporter NRAMP  43.34 
 
 		 532 aa  323  3e-87  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1861  Mn2+/Fe2+ transporter  42.07 
 
 		 530 aa  323  4e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000364072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  43.9 
 
 		 431 aa  322  8e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  43.9 
 
 		 431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  43.9 
 
 		 431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.86 
 
 		 439 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  43.55 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  44.33 
 
 		 434 aa  317  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  42.34 
 
 		 432 aa  317  4e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1183  manganese transporter NRAMP  45.02 
 
 		 473 aa  316  6e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  43.2 
 
 		 430 aa  313  4.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  40.71 
 
 		 439 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  42.02 
 
 		 423 aa  310  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  44.28 
 
 		 431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  44.28 
 
 		 431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  44.28 
 
 		 431 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>