279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0554 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  100 
 
 
429 aa  857    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  59.33 
 
 
429 aa  487  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  57.11 
 
 
428 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  56.21 
 
 
435 aa  461  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  58.53 
 
 
435 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  55.45 
 
 
444 aa  443  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  54.07 
 
 
435 aa  441  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  54.82 
 
 
439 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  56.8 
 
 
448 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  54.35 
 
 
428 aa  432  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  54.8 
 
 
429 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  53.72 
 
 
430 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  54.63 
 
 
423 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  54.46 
 
 
429 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  56.19 
 
 
433 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  51.22 
 
 
423 aa  414  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  52.47 
 
 
430 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  52.47 
 
 
430 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  50.36 
 
 
434 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  49.88 
 
 
432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  52.62 
 
 
430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  54.98 
 
 
437 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  54.1 
 
 
447 aa  378  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  49.63 
 
 
418 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  55.26 
 
 
422 aa  378  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  48.03 
 
 
432 aa  352  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  46.57 
 
 
423 aa  350  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  48.13 
 
 
423 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  48.13 
 
 
423 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  46.23 
 
 
434 aa  347  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  42.17 
 
 
434 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  41.34 
 
 
430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  41.09 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  41.09 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  42.58 
 
 
487 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  42.58 
 
 
484 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  41.67 
 
 
438 aa  301  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  41.48 
 
 
450 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  39.36 
 
 
420 aa  289  7e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  40.96 
 
 
420 aa  272  7e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  40.11 
 
 
382 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  39.68 
 
 
379 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  39.52 
 
 
409 aa  249  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  36.64 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  29.88 
 
 
415 aa  186  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  32 
 
 
432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  29.93 
 
 
408 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  30.29 
 
 
452 aa  160  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  30 
 
 
418 aa  159  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  28.3 
 
 
415 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  27.94 
 
 
432 aa  153  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  27.56 
 
 
432 aa  153  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4098  manganese transporter NRAMP  27.94 
 
 
419 aa  145  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  25.61 
 
 
438 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  29.52 
 
 
416 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  29.48 
 
 
425 aa  113  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  28.49 
 
 
422 aa  110  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  28.44 
 
 
421 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  28.02 
 
 
544 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  26.38 
 
 
419 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  27.54 
 
 
421 aa  104  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  29.26 
 
 
547 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  29.26 
 
 
547 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  29.26 
 
 
547 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  29.26 
 
 
547 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  29.26 
 
 
547 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  29.36 
 
 
547 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  24.18 
 
 
412 aa  100  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  28.72 
 
 
547 aa  99.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  26.07 
 
 
419 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  28.36 
 
 
421 aa  98.6  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  30.11 
 
 
547 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  24.64 
 
 
442 aa  94  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  24.88 
 
 
406 aa  92.8  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  27.67 
 
 
554 aa  91.3  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  26.7 
 
 
448 aa  90.5  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  28.25 
 
 
527 aa  89.7  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  25.64 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  29.2 
 
 
565 aa  88.6  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  26.01 
 
 
401 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  27.7 
 
 
448 aa  87.8  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  27.33 
 
 
414 aa  87.4  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  26.05 
 
 
542 aa  86.7  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  26.05 
 
 
456 aa  86.3  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  26.05 
 
 
456 aa  86.3  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  26.9 
 
 
553 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  22.63 
 
 
432 aa  83.6  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  25.42 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  25.81 
 
 
557 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  23.93 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  24.72 
 
 
456 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  25.81 
 
 
557 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  25.81 
 
 
557 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  25.81 
 
 
590 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  26.96 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  26.96 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  24.87 
 
 
445 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  25.62 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  27.68 
 
 
565 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  24.81 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>