288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1434 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  73.46 
 
 
425 aa  643    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
422 aa  837    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  69.62 
 
 
421 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  47.97 
 
 
421 aa  341  1e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  48.74 
 
 
421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  42.93 
 
 
448 aa  319  7.999999999999999e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  44.26 
 
 
456 aa  309  5e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  44.55 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  44.55 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  38.68 
 
 
457 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  39.76 
 
 
544 aa  290  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  40.72 
 
 
565 aa  275  9e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  41.11 
 
 
553 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  39.08 
 
 
552 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  39.61 
 
 
547 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  36.82 
 
 
442 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  40.15 
 
 
565 aa  266  7e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  39.15 
 
 
542 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  39.57 
 
 
547 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3507  natural resistance-associated macrophage protein  40.39 
 
 
548 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  40.39 
 
 
548 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  39.27 
 
 
547 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  39.57 
 
 
547 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  39.09 
 
 
547 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  39.09 
 
 
547 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  38.85 
 
 
547 aa  262  8.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  39.66 
 
 
548 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  40.15 
 
 
548 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  39.33 
 
 
547 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  38.69 
 
 
557 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  39.4 
 
 
554 aa  259  8e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  38.69 
 
 
557 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  38.69 
 
 
557 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  38.69 
 
 
590 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  41.82 
 
 
527 aa  256  5e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4756  natural resistance-associated macrophage protein  39.66 
 
 
548 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4233  natural resistance-associated macrophage protein  39.66 
 
 
548 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.694052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4721  putative natural resistance-associated macrophage protein  39.42 
 
 
547 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912608  normal  0.040481 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0313  manganese transporter NRAMP  38.93 
 
 
591 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  38.93 
 
 
558 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0269  manganese/iron transporter  39.17 
 
 
644 aa  243  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0493  manganese/iron transporter  38.69 
 
 
552 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  36.55 
 
 
415 aa  237  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  33.96 
 
 
432 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1740  natural resistance-associated macrophage protein  36.63 
 
 
557 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7399  putative manganese transport protein  39.01 
 
 
548 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248778  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  34.17 
 
 
432 aa  224  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  36.36 
 
 
408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  33.82 
 
 
418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  36.11 
 
 
452 aa  211  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  35.85 
 
 
438 aa  211  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  34.23 
 
 
419 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  34.56 
 
 
448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  33.69 
 
 
415 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  32.94 
 
 
416 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  33.54 
 
 
421 aa  187  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  33.54 
 
 
421 aa  187  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  32.19 
 
 
432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  34.05 
 
 
413 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0827  manganese transporter NRAMP  34.67 
 
 
431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  28.47 
 
 
420 aa  137  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1208  manganese transporter, putative  30.15 
 
 
424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1265  manganese transporter NRAMP  28.99 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.414287  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  29.31 
 
 
430 aa  119  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0451  natural resistance-associated macrophage protein  28.02 
 
 
399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  28.54 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1500  natural resistance-associated macrophage protein  27.43 
 
 
396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.146818  normal  0.532247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  27.86 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  28.07 
 
 
406 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  27.53 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  28.49 
 
 
429 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  26.32 
 
 
420 aa  109  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  31.02 
 
 
432 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25.51 
 
 
412 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0787  manganese transporter, putative  30.13 
 
 
394 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.809712  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  26.68 
 
 
434 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  27.9 
 
 
422 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  26.79 
 
 
439 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  26.94 
 
 
401 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  24.35 
 
 
428 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  27.99 
 
 
423 aa  103  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  28.5 
 
 
408 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  27.44 
 
 
435 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  27.66 
 
 
433 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  28.28 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  25.69 
 
 
429 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  28.12 
 
 
397 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  26.63 
 
 
435 aa  97.8  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  26.17 
 
 
423 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  26.17 
 
 
423 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  26.49 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  23.66 
 
 
416 aa  95.5  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  26.83 
 
 
444 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  25.84 
 
 
429 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  25.84 
 
 
429 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  25.71 
 
 
428 aa  88.6  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  24.16 
 
 
434 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  25.06 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  24.94 
 
 
430 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  23.95 
 
 
403 aa  87.4  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>