192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1265 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1265  manganese transporter NRAMP  100 
 
 
390 aa  748    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.414287  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1500  natural resistance-associated macrophage protein  61.13 
 
 
396 aa  491  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.146818  normal  0.532247 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0787  manganese transporter, putative  47.99 
 
 
394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.809712  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0451  natural resistance-associated macrophage protein  39.07 
 
 
399 aa  240  4e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1208  manganese transporter, putative  30.94 
 
 
424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  28.99 
 
 
422 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  28.13 
 
 
448 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  28.75 
 
 
421 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  28.75 
 
 
421 aa  107  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  29.26 
 
 
419 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  27.93 
 
 
425 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  29.26 
 
 
413 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  27.13 
 
 
416 aa  95.9  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  26.3 
 
 
415 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  25.82 
 
 
415 aa  90.9  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  27.03 
 
 
432 aa  90.9  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  26.85 
 
 
421 aa  90.5  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  25.06 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  25.52 
 
 
452 aa  83.6  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  23.38 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0827  manganese transporter NRAMP  29.51 
 
 
431 aa  80.9  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  27.57 
 
 
432 aa  80.5  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  25.08 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  24.92 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  25.94 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  24.67 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  22.83 
 
 
438 aa  75.1  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  24.26 
 
 
457 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  28.05 
 
 
527 aa  70.1  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  23.53 
 
 
456 aa  66.6  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  22.88 
 
 
456 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  22.88 
 
 
456 aa  64.7  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.64 
 
 
448 aa  63.9  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1815  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.42 
 
 
409 aa  63.5  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  23.9 
 
 
544 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  27.74 
 
 
565 aa  62.4  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  23.76 
 
 
448 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  27.1 
 
 
622 aa  60.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  26.1 
 
 
442 aa  60.1  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  22.37 
 
 
412 aa  60.1  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  21.52 
 
 
434 aa  60.1  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.55 
 
 
412 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  24.55 
 
 
412 aa  58.9  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  24.55 
 
 
412 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  21.54 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  24.55 
 
 
412 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  24.55 
 
 
412 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1822  Mn2+/Fe2+ transporter  26.17 
 
 
407 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  24.55 
 
 
412 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  23.83 
 
 
410 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4171  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.56 
 
 
433 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248736  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  24.55 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  26.81 
 
 
557 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  22.11 
 
 
412 aa  58.2  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  24.55 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  26.81 
 
 
557 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  26.81 
 
 
557 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  24.55 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  22.99 
 
 
412 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  26.81 
 
 
590 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  26.29 
 
 
431 aa  57.4  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  22.45 
 
 
412 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  23.58 
 
 
409 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  23.58 
 
 
409 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  23.53 
 
 
423 aa  56.6  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  23.82 
 
 
411 aa  56.6  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  32.99 
 
 
431 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1718  manganese transport protein MntH  32.99 
 
 
431 aa  55.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  30.12 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  24.31 
 
 
413 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0999  NRAMP family Mn2+ and Fe2+ transporter  31.36 
 
 
455 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.92 
 
 
432 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  32.99 
 
 
431 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  32.99 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  32.99 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  32.99 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.45 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  29.01 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  32.99 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  24.79 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.94 
 
 
625 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  24.07 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  24.07 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  24.07 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  24.07 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  24.69 
 
 
552 aa  53.9  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  25.12 
 
 
432 aa  53.5  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  22.74 
 
 
412 aa  53.1  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  28.57 
 
 
542 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  31.96 
 
 
431 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  39.73 
 
 
433 aa  52.8  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  31.96 
 
 
431 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  21.34 
 
 
430 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  23.04 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  23.2 
 
 
450 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  26.44 
 
 
429 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  23.2 
 
 
450 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  30.93 
 
 
432 aa  52.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  30.93 
 
 
431 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  24.24 
 
 
401 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>