285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6311 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
432 aa  855    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  65.79 
 
 
423 aa  549  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  57.69 
 
 
423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  54.42 
 
 
423 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  54.66 
 
 
428 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  51.17 
 
 
432 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  51.11 
 
 
430 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  52.58 
 
 
429 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  52.97 
 
 
434 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  50.12 
 
 
429 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  50.86 
 
 
429 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  48.74 
 
 
435 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  55.66 
 
 
422 aa  375  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  50.37 
 
 
430 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  50.61 
 
 
428 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  50.37 
 
 
430 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  50.37 
 
 
430 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  48.03 
 
 
429 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  49.88 
 
 
444 aa  365  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  49.28 
 
 
418 aa  362  9e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  47.65 
 
 
435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  48.66 
 
 
435 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  48.47 
 
 
448 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  50.37 
 
 
439 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  49.38 
 
 
433 aa  354  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  48.23 
 
 
434 aa  351  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  48.49 
 
 
437 aa  328  8e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  44.37 
 
 
438 aa  328  9e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  41.75 
 
 
420 aa  323  4e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  45.89 
 
 
420 aa  317  3e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  49.61 
 
 
423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  49.61 
 
 
423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  41.38 
 
 
430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  41.38 
 
 
430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  41.38 
 
 
430 aa  306  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  48.54 
 
 
447 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  40.84 
 
 
450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  42.86 
 
 
434 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  41.91 
 
 
487 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  41.91 
 
 
484 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  38.61 
 
 
379 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  39.15 
 
 
382 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  35.96 
 
 
409 aa  233  6e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  39.04 
 
 
433 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  32.82 
 
 
415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  33.59 
 
 
432 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  31.2 
 
 
408 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  31.27 
 
 
432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  31.03 
 
 
452 aa  169  7e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  31.81 
 
 
418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  31.17 
 
 
432 aa  162  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  29.55 
 
 
415 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  30.02 
 
 
438 aa  146  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4098  manganese transporter NRAMP  27.13 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  28.25 
 
 
425 aa  120  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  27.21 
 
 
544 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  31.02 
 
 
422 aa  113  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  29.59 
 
 
547 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  30.22 
 
 
547 aa  106  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  29.59 
 
 
547 aa  106  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  29.38 
 
 
542 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  29.36 
 
 
547 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  29.36 
 
 
547 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  29.36 
 
 
547 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  28.57 
 
 
421 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  29.59 
 
 
547 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  28.26 
 
 
554 aa  103  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  29.12 
 
 
547 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  28.24 
 
 
421 aa  102  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  29.68 
 
 
552 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  29.13 
 
 
421 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  29.13 
 
 
421 aa  100  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  30 
 
 
557 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  29.58 
 
 
557 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  29.58 
 
 
557 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  29.36 
 
 
416 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  29.58 
 
 
590 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  29.74 
 
 
414 aa  98.2  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  29.98 
 
 
565 aa  93.6  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  29.37 
 
 
565 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  25.69 
 
 
442 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  28.74 
 
 
553 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4721  putative natural resistance-associated macrophage protein  28.68 
 
 
547 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912608  normal  0.040481 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  27.98 
 
 
448 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  26.94 
 
 
527 aa  89.4  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  23.5 
 
 
412 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0493  manganese/iron transporter  29.58 
 
 
552 aa  88.6  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  25.25 
 
 
421 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  24.43 
 
 
414 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  24.93 
 
 
419 aa  88.2  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  29.58 
 
 
558 aa  88.2  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  28.39 
 
 
442 aa  87.4  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0313  manganese transporter NRAMP  30 
 
 
591 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  28.71 
 
 
548 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0269  manganese/iron transporter  29.34 
 
 
644 aa  86.7  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  28.57 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  28.78 
 
 
548 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  28.78 
 
 
548 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  26.14 
 
 
415 aa  84  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  26.97 
 
 
398 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>