126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4098 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4098  manganese transporter NRAMP  100 
 
 
419 aa  836    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  30.37 
 
 
435 aa  167  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  30.59 
 
 
444 aa  166  9e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  29.9 
 
 
423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  29.46 
 
 
428 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  30.22 
 
 
430 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  28.64 
 
 
432 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  30.05 
 
 
434 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  27.84 
 
 
435 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  30.03 
 
 
430 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  30.03 
 
 
430 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  28.79 
 
 
435 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  29.04 
 
 
450 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  30.18 
 
 
434 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  30 
 
 
448 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  29.5 
 
 
430 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  27.34 
 
 
429 aa  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  29.92 
 
 
429 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  28.05 
 
 
430 aa  149  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  27.81 
 
 
434 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  27.68 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  29.24 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  29.24 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  30.14 
 
 
428 aa  147  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  29.62 
 
 
429 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  30.03 
 
 
423 aa  144  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  27.84 
 
 
487 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  27.84 
 
 
484 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  28.07 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  27.2 
 
 
423 aa  136  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  29.13 
 
 
420 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  28.34 
 
 
439 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  27.51 
 
 
420 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  28.97 
 
 
422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  27.13 
 
 
432 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  27.25 
 
 
438 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  28.4 
 
 
379 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  25.91 
 
 
432 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  29.02 
 
 
437 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  27.37 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  28.64 
 
 
447 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  29.04 
 
 
423 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  29.04 
 
 
423 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  26.8 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  22.52 
 
 
415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  24.37 
 
 
433 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  23.63 
 
 
418 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  23.54 
 
 
432 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  23.27 
 
 
432 aa  105  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  23.69 
 
 
452 aa  102  1e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  24.03 
 
 
415 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  23.02 
 
 
438 aa  98.6  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  22.34 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  26.45 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  26.88 
 
 
421 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  26.88 
 
 
421 aa  79.7  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  25.67 
 
 
448 aa  78.2  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  23.02 
 
 
442 aa  77  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  26.67 
 
 
416 aa  76.6  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  23.97 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  23.97 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  23.97 
 
 
456 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  20.2 
 
 
403 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  22.38 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  23.21 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  24.77 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  24.32 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  22.83 
 
 
401 aa  64.7  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  21.94 
 
 
422 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  22.64 
 
 
457 aa  63.5  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  22.57 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  23.72 
 
 
401 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  23.96 
 
 
448 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  20.99 
 
 
421 aa  57.4  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  22.33 
 
 
416 aa  57.4  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  23.96 
 
 
406 aa  57  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  20.83 
 
 
421 aa  57  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  22.47 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  25.11 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.11 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  25.11 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  25.11 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  25.11 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  25.11 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  25.11 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  25.11 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  25.11 
 
 
412 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1876  natural resistance-associated macrophage protein  24.35 
 
 
409 aa  53.5  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  23.68 
 
 
428 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  25.12 
 
 
412 aa  53.1  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  24.68 
 
 
413 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  24.44 
 
 
392 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  24.44 
 
 
392 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  24.44 
 
 
392 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  24.44 
 
 
392 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  24.86 
 
 
434 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  25.33 
 
 
412 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  21.99 
 
 
421 aa  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  25.67 
 
 
412 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  24.08 
 
 
409 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>