240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1876 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1876  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 		 409 aa  796    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5209  putative Mn2+/Fe2+ transporter protein  35.57 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112749  normal  0.693685 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  28.35 
 
 		 452 aa  130  4.0000000000000003e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  25.61 
 
 		 415 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  24.24 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  28.18 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  22.68 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  23.61 
 
 		 432 aa  113  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  23.59 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  27.14 
 
 		 416 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  26.5 
 
 		 438 aa  104  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  24.33 
 
 		 457 aa  90.9  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  22.87 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  24.32 
 
 		 456 aa  89  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  24.05 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  25.74 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.61 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  25.74 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  25.68 
 
 		 554 aa  80.5  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  27.04 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  22.79 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  24.94 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  28.61 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  24.14 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  27.13 
 
 		 547 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  24.28 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  23.98 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  25 
 
 		 544 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  24.5 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  22.31 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  26.4 
 
 		 527 aa  71.6  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  23.08 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  24.23 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  23.82 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  23.82 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  24.94 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3349  hypothetical protein  42.86 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.895461  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  23.28 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  25.19 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  23.8 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  23.77 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  24.37 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  23.18 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  23.77 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  24.42 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  23.77 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  23.77 
 
 		 392 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  23.77 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  24.17 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  26.81 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  26.81 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  24.93 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  21.56 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  26.81 
 
 		 547 aa  67  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  23.71 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  28.95 
 
 		 433 aa  67  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  24.37 
 
 		 438 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  24.48 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  25.34 
 
 		 553 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  25.34 
 
 		 547 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  25.41 
 
 		 547 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  26.81 
 
 		 547 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  21.53 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  22.73 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  24.06 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  25.19 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  24.08 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  24.22 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  23.14 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  22.74 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  22.74 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  22.74 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  22.74 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  22.74 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  22.74 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  24.87 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  22.74 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  27.64 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  24.87 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  24.87 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  22.74 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  22.74 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4904  manganese transport protein MntH  29.83 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  24.51 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  23.51 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  24.06 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  29.41 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  23.84 
 
 		 542 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  26.34 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  23.26 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  26.63 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  26.63 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  22.52 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  26.63 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  26.63 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  26.63 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  29.72 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  28.14 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  26.29 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  20.86 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>