More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1448 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  71.48 
 
 
547 aa  708    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  69.96 
 
 
547 aa  706    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0313  manganese transporter NRAMP  66.97 
 
 
591 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  65.69 
 
 
552 aa  699    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  70.74 
 
 
547 aa  707    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  66.79 
 
 
557 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  66.61 
 
 
557 aa  674    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4721  putative natural resistance-associated macrophage protein  65.98 
 
 
547 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912608  normal  0.040481 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0493  manganese/iron transporter  66.55 
 
 
552 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  71.64 
 
 
547 aa  711    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  67.9 
 
 
548 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  70.93 
 
 
547 aa  706    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  67.52 
 
 
565 aa  672    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  70.74 
 
 
547 aa  707    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0269  manganese/iron transporter  66.18 
 
 
644 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4756  natural resistance-associated macrophage protein  68.82 
 
 
548 aa  662    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  72.2 
 
 
547 aa  713    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3507  natural resistance-associated macrophage protein  67.1 
 
 
548 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  70.43 
 
 
542 aa  706    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  69.31 
 
 
544 aa  745    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4233  natural resistance-associated macrophage protein  68.82 
 
 
548 aa  662    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.694052 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  67.1 
 
 
548 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  67.28 
 
 
548 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  66.79 
 
 
557 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  69.57 
 
 
547 aa  704    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  74.95 
 
 
553 aa  743    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  66.79 
 
 
590 aa  676    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  100 
 
 
554 aa  1097    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  66.97 
 
 
558 aa  657    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7399  putative manganese transport protein  63.03 
 
 
548 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248778  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1740  natural resistance-associated macrophage protein  55.58 
 
 
557 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  54.07 
 
 
565 aa  477  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  47.29 
 
 
527 aa  345  1e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  38.65 
 
 
425 aa  278  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  39.4 
 
 
422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  38.41 
 
 
421 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  34.81 
 
 
456 aa  236  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  34.81 
 
 
456 aa  236  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  37.41 
 
 
448 aa  234  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  35.12 
 
 
456 aa  233  8.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  37.01 
 
 
457 aa  230  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  35.99 
 
 
421 aa  225  2e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  36.66 
 
 
421 aa  223  6e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  32.82 
 
 
415 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  32.73 
 
 
442 aa  209  9e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  38.16 
 
 
419 aa  206  7e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  31.44 
 
 
418 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  31.65 
 
 
432 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  36.06 
 
 
421 aa  193  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  36.06 
 
 
421 aa  193  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  32.51 
 
 
408 aa  190  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  32.43 
 
 
432 aa  188  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  36.28 
 
 
416 aa  184  3e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  31.03 
 
 
415 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  35.79 
 
 
448 aa  179  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  31.74 
 
 
432 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  30.3 
 
 
452 aa  172  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  30.2 
 
 
438 aa  158  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0827  manganese transporter NRAMP  34.32 
 
 
431 aa  148  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  34.16 
 
 
413 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  27.76 
 
 
430 aa  121  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  26.01 
 
 
423 aa  109  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  28.01 
 
 
432 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  26.73 
 
 
412 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  28.28 
 
 
429 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  25.54 
 
 
420 aa  105  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  27.37 
 
 
435 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  27.27 
 
 
429 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  26.75 
 
 
423 aa  101  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  26.5 
 
 
418 aa  99.4  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  25.46 
 
 
433 aa  97.8  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  27.76 
 
 
429 aa  97.4  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  27.67 
 
 
429 aa  97.1  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  25.66 
 
 
428 aa  97.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  26.95 
 
 
432 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  26.67 
 
 
435 aa  95.5  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  28.64 
 
 
422 aa  95.5  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  28.43 
 
 
439 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  26.65 
 
 
434 aa  95.1  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  27.65 
 
 
408 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  26.65 
 
 
428 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  24.08 
 
 
434 aa  92.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  26.29 
 
 
414 aa  92.8  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  24.44 
 
 
423 aa  91.7  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  28.17 
 
 
448 aa  91.3  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  28.18 
 
 
435 aa  90.9  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  27.05 
 
 
438 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  27.05 
 
 
438 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  27.05 
 
 
438 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  27.65 
 
 
436 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  26.18 
 
 
416 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  29.75 
 
 
419 aa  90.1  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  27.65 
 
 
436 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  28.28 
 
 
441 aa  90.1  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  27.65 
 
 
436 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1208  manganese transporter, putative  24.94 
 
 
424 aa  88.2  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  27.23 
 
 
438 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  25.46 
 
 
427 aa  87  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  25.97 
 
 
406 aa  85.5  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  25.85 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>