291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0106 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  100 
 
 		 421 aa  826    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 		 421 aa  826    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  65.01 
 
 		 416 aa  486  1e-136  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  52.36 
 
 		 419 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  55.64 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  56.19 
 
 		 413 aa  358  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0827  manganese transporter NRAMP  51.77 
 
 		 431 aa  328  9e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  39.26 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  38.92 
 
 		 421 aa  227  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  35.79 
 
 		 425 aa  217  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  35.83 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  33.88 
 
 		 422 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  34.68 
 
 		 544 aa  196  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  31.17 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  35.29 
 
 		 554 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  31.54 
 
 		 415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1208  manganese transporter, putative  33.57 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  33.67 
 
 		 542 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  35.9 
 
 		 553 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  35.41 
 
 		 457 aa  183  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  33.86 
 
 		 552 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  32.23 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  32.18 
 
 		 442 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  31.94 
 
 		 408 aa  177  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  35.09 
 
 		 456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  35.09 
 
 		 456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  33.16 
 
 		 547 aa  172  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  29.16 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  34.14 
 
 		 547 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  28.84 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  33.77 
 
 		 547 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  34.04 
 
 		 547 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  33.69 
 
 		 547 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  31.99 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  33.69 
 
 		 547 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  33.94 
 
 		 557 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  33.94 
 
 		 557 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  33.94 
 
 		 590 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  33.23 
 
 		 557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  34.13 
 
 		 547 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  34.13 
 
 		 547 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  33.16 
 
 		 548 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  33.07 
 
 		 456 aa  163  7e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  33.16 
 
 		 565 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  33.76 
 
 		 548 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3507  natural resistance-associated macrophage protein  33.76 
 
 		 548 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  33.76 
 
 		 548 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  30.9 
 
 		 448 aa  160  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1740  natural resistance-associated macrophage protein  32.09 
 
 		 557 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4721  putative natural resistance-associated macrophage protein  32.89 
 
 		 547 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912608  normal  0.040481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0269  manganese/iron transporter  34.65 
 
 		 644 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  30.87 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0493  manganese/iron transporter  33.94 
 
 		 552 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  28.83 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  34.04 
 
 		 558 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0313  manganese transporter NRAMP  34.04 
 
 		 591 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  33.73 
 
 		 565 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4756  natural resistance-associated macrophage protein  33.14 
 
 		 548 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4233  natural resistance-associated macrophage protein  33.14 
 
 		 548 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.694052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7399  putative manganese transport protein  33.51 
 
 		 548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  30.75 
 
 		 527 aa  136  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0787  manganese transporter, putative  30.99 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.809712  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0451  natural resistance-associated macrophage protein  29.97 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  29.7 
 
 		 434 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1500  natural resistance-associated macrophage protein  27.58 
 
 		 396 aa  113  8.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.146818  normal  0.532247 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1265  manganese transporter NRAMP  28.75 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.414287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1807  manganese transporter NRAMP  49.12 
 
 		 140 aa  96.3  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0287  hypothetical protein  49.12 
 
 		 140 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00972659  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1309  manganese transporter NRAMP  49.12 
 
 		 140 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  26.46 
 
 		 423 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  26.01 
 
 		 432 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  26.52 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  25.83 
 
 		 447 aa  90.9  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  26.72 
 
 		 419 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  27.12 
 
 		 428 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  26.04 
 
 		 397 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1735  manganese transport protein MntH  26.3 
 
 		 456 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  26.65 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  26.19 
 
 		 435 aa  87.8  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  26.78 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  28.35 
 
 		 439 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  27.25 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  26.76 
 
 		 406 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  25.62 
 
 		 429 aa  86.3  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  28.02 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1555  Mn2+/Fe2+ transporter  27.33 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000268932  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  26.74 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  27.57 
 
 		 418 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25.89 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  26.5 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  27.17 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  28.88 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  26.67 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  26.67 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  28.88 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  27.76 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  27.73 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  26.88 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  25.34 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1441  manganese transport protein MntH  25.62 
 
 		 456 aa  83.2  0.000000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.266058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>