297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2816 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  95.78 
 
 		 547 aa  997    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  87.55 
 
 		 547 aa  906    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  71.54 
 
 		 544 aa  743    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  72.89 
 
 		 553 aa  716    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  65.44 
 
 		 557 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  95.78 
 
 		 547 aa  993    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  67.98 
 
 		 565 aa  663    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0493  manganese/iron transporter  66.24 
 
 		 552 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  67.29 
 
 		 548 aa  670    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0269  manganese/iron transporter  65.08 
 
 		 644 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  67.6 
 
 		 548 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  65.24 
 
 		 552 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  70.69 
 
 		 542 aa  708    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3507  natural resistance-associated macrophage protein  67.42 
 
 		 548 aa  663    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  65.62 
 
 		 557 aa  657    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4233  natural resistance-associated macrophage protein  67.54 
 
 		 548 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.694052 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  97.81 
 
 		 547 aa  1024    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  96.15 
 
 		 547 aa  1002    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  67.6 
 
 		 548 aa  665    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4756  natural resistance-associated macrophage protein  67.54 
 
 		 548 aa  656    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  96.15 
 
 		 547 aa  1002    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  96.15 
 
 		 547 aa  1004    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  65.62 
 
 		 557 aa  657    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 		 547 aa  1079    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  65.62 
 
 		 590 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0313  manganese transporter NRAMP  65.81 
 
 		 591 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  72.2 
 
 		 554 aa  711    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  65.81 
 
 		 558 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4721  putative natural resistance-associated macrophage protein  66.99 
 
 		 547 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912608  normal  0.040481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7399  putative manganese transport protein  61.8 
 
 		 548 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1740  natural resistance-associated macrophage protein  59.54 
 
 		 557 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  55.09 
 
 		 565 aa  478  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  48.26 
 
 		 527 aa  369  1e-101  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  39.9 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  39.36 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  40.48 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  40.34 
 
 		 457 aa  259  7e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  37.53 
 
 		 421 aa  247  4e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  35.53 
 
 		 456 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  35.53 
 
 		 456 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  37.72 
 
 		 421 aa  242  2e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  37.44 
 
 		 456 aa  239  8e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  38.37 
 
 		 448 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  35.16 
 
 		 415 aa  223  8e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  35.64 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  32.3 
 
 		 418 aa  207  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  33 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  37.06 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  32.59 
 
 		 432 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  32.92 
 
 		 408 aa  192  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  31.44 
 
 		 452 aa  185  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  31.44 
 
 		 415 aa  179  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  35.47 
 
 		 448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  34.43 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  34.43 
 
 		 421 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  34.99 
 
 		 416 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  31.57 
 
 		 432 aa  163  9e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  30.85 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0827  manganese transporter NRAMP  32.14 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  32.12 
 
 		 413 aa  134  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  26.25 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  28.71 
 
 		 420 aa  113  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  28.02 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  28.53 
 
 		 429 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  29.88 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  25.75 
 
 		 423 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  26.32 
 
 		 418 aa  105  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  29.71 
 
 		 406 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  27.18 
 
 		 423 aa  101  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  27.48 
 
 		 434 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  29.5 
 
 		 439 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  29.56 
 
 		 419 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  25.86 
 
 		 429 aa  94.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  25.47 
 
 		 434 aa  93.6  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  26.57 
 
 		 438 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  27.95 
 
 		 429 aa  92  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  27.75 
 
 		 428 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  27.75 
 
 		 429 aa  90.9  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  27.48 
 
 		 414 aa  90.1  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  24.61 
 
 		 428 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  27.19 
 
 		 438 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  24.69 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  25.18 
 
 		 404 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  27.58 
 
 		 448 aa  88.6  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  25.72 
 
 		 433 aa  87.8  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  27.23 
 
 		 435 aa  87.4  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  24.6 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  26.37 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  26.48 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  26.48 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  26.48 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  28.57 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  28.57 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  27.97 
 
 		 408 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  27.23 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  24.64 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  26.3 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  25.76 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  26.3 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  26.3 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>