295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2019 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  100 
 
 
435 aa  861    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  69.66 
 
 
435 aa  591  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  67.74 
 
 
444 aa  578  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  65.19 
 
 
435 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  64.68 
 
 
437 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  64.53 
 
 
447 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  60.14 
 
 
439 aa  483  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  60.14 
 
 
448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  56.21 
 
 
429 aa  464  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  58.27 
 
 
428 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  55.43 
 
 
429 aa  442  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  54.26 
 
 
430 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  54.85 
 
 
423 aa  415  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  53.04 
 
 
428 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  51.88 
 
 
432 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  52.8 
 
 
429 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  51.75 
 
 
430 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  51.75 
 
 
430 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  53.92 
 
 
429 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  51.75 
 
 
430 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  49.88 
 
 
423 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  49.52 
 
 
434 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  52.29 
 
 
433 aa  388  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  51.94 
 
 
418 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  46.98 
 
 
434 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  51.65 
 
 
422 aa  362  8e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  49.02 
 
 
423 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  49.02 
 
 
423 aa  351  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  47.65 
 
 
432 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  44.94 
 
 
423 aa  344  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  46.57 
 
 
487 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  46.44 
 
 
484 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  43.38 
 
 
450 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  42.68 
 
 
420 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  41.31 
 
 
430 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  41.55 
 
 
430 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  41.55 
 
 
430 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  43.07 
 
 
434 aa  309  8e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  41.11 
 
 
438 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  42.89 
 
 
420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  43.73 
 
 
382 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  41.29 
 
 
379 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  37.76 
 
 
409 aa  252  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  38.07 
 
 
433 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  28.36 
 
 
415 aa  172  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  31.62 
 
 
432 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  30.3 
 
 
452 aa  166  6.9999999999999995e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  32.35 
 
 
415 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  29.62 
 
 
432 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  29.25 
 
 
418 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  29.68 
 
 
408 aa  155  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4098  manganese transporter NRAMP  28.79 
 
 
419 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.733357  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  29.65 
 
 
432 aa  147  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  28.82 
 
 
438 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  26.87 
 
 
421 aa  107  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  26.73 
 
 
421 aa  105  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  29.57 
 
 
420 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  27.07 
 
 
425 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  24.58 
 
 
412 aa  103  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  25.96 
 
 
434 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  26.6 
 
 
544 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  26.63 
 
 
422 aa  100  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  25.98 
 
 
442 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  23.88 
 
 
456 aa  97.8  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  26.88 
 
 
419 aa  97.8  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  27.2 
 
 
419 aa  97.1  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  26.72 
 
 
439 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  27.7 
 
 
448 aa  95.5  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  25.85 
 
 
456 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  25.85 
 
 
456 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  25.13 
 
 
404 aa  94.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  26.79 
 
 
445 aa  94  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  26.95 
 
 
554 aa  93.2  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  24.87 
 
 
414 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  25.97 
 
 
432 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.09 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  28.88 
 
 
457 aa  91.3  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  26.72 
 
 
527 aa  90.9  4e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.58 
 
 
432 aa  90.5  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  22.88 
 
 
414 aa  90.5  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  23.06 
 
 
397 aa  90.5  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  28.62 
 
 
411 aa  90.1  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  26.09 
 
 
441 aa  90.1  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  25.3 
 
 
421 aa  90.1  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  25.73 
 
 
398 aa  89.7  8e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  27.73 
 
 
442 aa  89.7  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  22.84 
 
 
427 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  25.85 
 
 
438 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  26.18 
 
 
434 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  23.62 
 
 
425 aa  87.8  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  26.3 
 
 
542 aa  87.8  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  25.51 
 
 
415 aa  87  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  29.19 
 
 
438 aa  86.7  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  29.19 
 
 
438 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  29.19 
 
 
438 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  29.19 
 
 
438 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  27.83 
 
 
413 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  27.25 
 
 
547 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  27.01 
 
 
547 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  27.25 
 
 
547 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>