258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5256 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_5256  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
409 aa  824    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  39.9 
 
 
428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  43.56 
 
 
428 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  43.35 
 
 
429 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  43.1 
 
 
429 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  41.13 
 
 
432 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  41.58 
 
 
430 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  41.34 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  41.34 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  40.35 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  38.07 
 
 
423 aa  272  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  39.39 
 
 
435 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  40.82 
 
 
430 aa  269  5.9999999999999995e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  40.25 
 
 
448 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  39.46 
 
 
444 aa  259  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  37.72 
 
 
435 aa  257  3e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  39.52 
 
 
429 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  39.21 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  37.93 
 
 
439 aa  250  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  39.8 
 
 
423 aa  249  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  38.37 
 
 
434 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  36.65 
 
 
423 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  37.29 
 
 
434 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  38.85 
 
 
433 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6056  natural resistance-associated macrophage protein  36.95 
 
 
430 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.093688 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  37.68 
 
 
423 aa  235  8e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  37.68 
 
 
423 aa  235  8e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1365  natural resistance-associated macrophage protein  37.47 
 
 
430 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.715588  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6464  natural resistance-associated macrophage protein  37.47 
 
 
430 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5461  natural resistance-associated macrophage protein  35.9 
 
 
434 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564733 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3145  putative transporter  37.38 
 
 
487 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3016  putative transporter  38.26 
 
 
484 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  38.59 
 
 
422 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  35.31 
 
 
432 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6380  natural resistance-associated macrophage protein  35.45 
 
 
450 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455308  normal  0.342343 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2482  natural resistance-associated macrophage protein  36.66 
 
 
418 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.196425  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  36.75 
 
 
437 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  33.96 
 
 
420 aa  193  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6159  natural resistance-associated macrophage protein  35.58 
 
 
447 aa  190  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  33.59 
 
 
438 aa  186  6e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1365  putative transport related, membrane protein  35.34 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5632  natural resistance-associated macrophage protein  32.8 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0218907  normal  0.0416816 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  34.3 
 
 
420 aa  173  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  30.54 
 
 
433 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  27.18 
 
 
415 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  28.16 
 
 
418 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  25.67 
 
 
452 aa  131  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  24.41 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  26.55 
 
 
432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  28.26 
 
 
432 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  26.32 
 
 
432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  27.21 
 
 
415 aa  126  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  22.89 
 
 
438 aa  89.7  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  26.9 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  26.9 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  26.9 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  26.53 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  24.54 
 
 
422 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  25.43 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  19.53 
 
 
414 aa  79  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  26.9 
 
 
438 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  22.71 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  27.51 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  26.59 
 
 
391 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  24.73 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  25.13 
 
 
441 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  22.83 
 
 
421 aa  76.6  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  22.83 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  25.39 
 
 
544 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.5 
 
 
432 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  26.32 
 
 
452 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  25.73 
 
 
437 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  23.99 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  25.61 
 
 
441 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  25.73 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  25.73 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  25.73 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  25.73 
 
 
437 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  24.69 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  25.73 
 
 
454 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  26.94 
 
 
438 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  24.91 
 
 
438 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  21.43 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.84 
 
 
415 aa  71.2  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  22.76 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  19.65 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1258  manganese/iron transporter  23.83 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  24.42 
 
 
428 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0230  manganese/iron transporter  23.83 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0502  manganese/iron transporter  23.83 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1414  manganese/iron transporter  23.83 
 
 
437 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1068  manganese/iron transporter  23.83 
 
 
437 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.028316  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  24.15 
 
 
425 aa  69.3  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  22.94 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2576  manganese/iron transporter  23.83 
 
 
449 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.202281  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  24.44 
 
 
442 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  22.94 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  22.94 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1332  manganese/iron transporter  23.83 
 
 
437 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  24.26 
 
 
527 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>