200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0157 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1039  natural resistance-associated macrophage protein  87.72 
 
 
456 aa  798    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202233  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0157  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
456 aa  901    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0920  metal ion transporter, NRAMP family  87.72 
 
 
456 aa  798    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.291485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2190  natural resistance-associated macrophage protein  61.5 
 
 
448 aa  496  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3564  natural resistance-associated macrophage protein  52.61 
 
 
457 aa  456  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0090  natural resistance-associated macrophage protein  44.15 
 
 
425 aa  318  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0692094 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1434  natural resistance-associated macrophage protein  44.26 
 
 
422 aa  317  3e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000000145386  hitchhiker  0.000182924 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  44.93 
 
 
421 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0793  natural resistance-associated macrophage protein  43.99 
 
 
421 aa  291  1e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629468  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0540  natural resistance-associated macrophage protein  43.8 
 
 
421 aa  289  6e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2191  natural resistance-associated macrophage protein  36.04 
 
 
442 aa  278  1e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1553  putative manganese transport protein  36 
 
 
544 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416642  normal  0.182816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7455  putative manganese transport transmembrane protein  37.59 
 
 
542 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0596  natural resistance-associated macrophage protein  41.22 
 
 
565 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.105517  normal  0.316821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1588  natural resistance-associated macrophage protein  36.4 
 
 
547 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1667  natural resistance-associated macrophage protein  38.16 
 
 
547 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2949  natural resistance-associated macrophage protein  38.16 
 
 
547 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535895  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0027  putative manganese transport transmembrane protein  37.38 
 
 
547 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.328222  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3164  natural resistance-associated macrophage protein  38.16 
 
 
547 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000567211 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2816  natural resistance-associated macrophage protein  37.35 
 
 
547 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4770  natural resistance-associated macrophage protein  36.53 
 
 
552 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4990  natural resistance-associated macrophage protein  37.68 
 
 
547 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0850771  normal  0.0195368 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4859  natural resistance-associated macrophage protein  37.58 
 
 
548 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2534  natural resistance-associated macrophage protein  37.59 
 
 
547 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.608693 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0855  manganese transporter NRAMP  39.34 
 
 
548 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.124704  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3507  natural resistance-associated macrophage protein  37.58 
 
 
548 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5425  manganese transporter NRAMP  37.37 
 
 
548 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3736  natural resistance-associated macrophage protein  36.88 
 
 
565 aa  239  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232483  normal  0.0769712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3712  putative membrane transport protein  38.35 
 
 
553 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0476  natural resistance-associated macrophage protein  38.71 
 
 
527 aa  233  7.000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1448  putative membrane transport protein  35.12 
 
 
554 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.665329  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4233  natural resistance-associated macrophage protein  38.35 
 
 
548 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.694052 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4756  natural resistance-associated macrophage protein  38.35 
 
 
548 aa  229  7e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7399  putative manganese transport protein  38.37 
 
 
548 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.248778  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3358  manganese/iron transporter  35.76 
 
 
557 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.889885  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2067  manganese/iron transporter  35.76 
 
 
590 aa  226  8e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3027  manganese/iron transporter  35.76 
 
 
557 aa  226  9e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2656  manganese/iron transporter  35.76 
 
 
557 aa  226  9e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111777  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4721  putative natural resistance-associated macrophage protein  37.09 
 
 
547 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912608  normal  0.040481 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0269  manganese/iron transporter  36.45 
 
 
644 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  34.94 
 
 
415 aa  216  8e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0300  manganese transporter NRAMP  36 
 
 
558 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0493  manganese/iron transporter  36 
 
 
552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0313  manganese transporter NRAMP  36 
 
 
591 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  32.62 
 
 
418 aa  208  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1740  natural resistance-associated macrophage protein  35.79 
 
 
557 aa  206  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.200445 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1631  metal ion transporter, NRAMP family  34.23 
 
 
419 aa  201  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  31.51 
 
 
432 aa  192  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  31.34 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  31.01 
 
 
452 aa  182  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  29.9 
 
 
408 aa  181  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0308  metal ion transporter, nramp family protein  33.51 
 
 
448 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  32.03 
 
 
415 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1405  natural resistance-associated macrophage protein  32.43 
 
 
416 aa  176  5e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  31.12 
 
 
438 aa  169  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2017  natural resistance-associated macrophage protein  35.47 
 
 
413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0105  metal ion transporter, NRAMP family  32.75 
 
 
421 aa  156  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.746407  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0106  natural resistance-associated macrophage protein  32.75 
 
 
421 aa  156  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0827  manganese transporter NRAMP  31.69 
 
 
431 aa  146  9e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  29.1 
 
 
432 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0451  natural resistance-associated macrophage protein  31.87 
 
 
399 aa  121  3e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  26.93 
 
 
430 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0879  putative manganese transport protein  27.07 
 
 
448 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2019  Mn2+/Fe2+ transporter  23.88 
 
 
435 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.612831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  25.19 
 
 
420 aa  98.6  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1208  manganese transporter, putative  26.23 
 
 
424 aa  98.6  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  25.63 
 
 
429 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1691  natural resistance-associated macrophage protein  24.49 
 
 
428 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  25.13 
 
 
438 aa  93.6  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  27.02 
 
 
439 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  24.32 
 
 
432 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0787  manganese transporter, putative  26.84 
 
 
394 aa  90.1  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.809712  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1876  natural resistance-associated macrophage protein  24.73 
 
 
409 aa  89.7  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  24.43 
 
 
435 aa  88.2  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  24.12 
 
 
435 aa  86.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  26.29 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  25.99 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  22.96 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0554  Mn2+/Fe2+ transporter  24.57 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  25.93 
 
 
429 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  23.82 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  23.5 
 
 
444 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  25.5 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  25.5 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  26.8 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  25.56 
 
 
434 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6311  natural resistance-associated macrophage protein  25.91 
 
 
432 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  27.78 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6929  natural resistance-associated macrophage protein  27.65 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  25.06 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  25.06 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  25.11 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  25.11 
 
 
450 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  24.59 
 
 
420 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2981  putative manganese transport protein  23.57 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1500  natural resistance-associated macrophage protein  23.37 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.146818  normal  0.532247 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2410  natural resistance-associated macrophage protein  25.13 
 
 
433 aa  72.4  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.942705 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1265  manganese transporter NRAMP  23.62 
 
 
390 aa  72.4  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.414287  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  27.43 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2033  natural resistance-associated macrophage protein  24.16 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>