166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3643 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3643  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 		 412 aa  806    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.145249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  36.12 
 
 		 418 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  27.79 
 
 		 401 aa  130  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  28.14 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  27.59 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  26.62 
 
 		 439 aa  100  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  27.3 
 
 		 404 aa  96.7  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  26.45 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  24.94 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  26 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  26.95 
 
 		 406 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  23.6 
 
 		 414 aa  90.9  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  24.28 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  25.75 
 
 		 452 aa  87.8  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  25.51 
 
 		 415 aa  87.4  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  26.03 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  26.42 
 
 		 398 aa  87  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  24.5 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  27.5 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  27.5 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  27.5 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2933  natural resistance-associated macrophage protein  27.06 
 
 		 453 aa  84.7  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  25.31 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  23.75 
 
 		 427 aa  83.6  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  27 
 
 		 438 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  25.76 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  24.88 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  25.19 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  27 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.23 
 
 		 429 aa  79.7  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  25.38 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  23.9 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  24.12 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  25.58 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  24.43 
 
 		 397 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  25 
 
 		 456 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  26.04 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  22.62 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.59 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  24.43 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.15 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  26.79 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  26.79 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  26.79 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  26.79 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  25 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  25.38 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.25 
 
 		 448 aa  72.8  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  26.56 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  24.81 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  26.82 
 
 		 622 aa  70.1  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4637  manganese transport protein MntH  27.75 
 
 		 442 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0299874  normal  0.367834 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  23.47 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  24.81 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4935  manganese transport protein MntH  28.03 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.586063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.88 
 
 		 625 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  25.44 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  21.74 
 
 		 433 aa  68.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  23.95 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1064  natural resistance-associated macrophage protein  25.55 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.262705  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0856  manganese transport protein MntH  26.68 
 
 		 454 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0300571 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.04 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0541  Mn2+/Fe2+ transporter  23.4 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.72 
 
 		 627 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  25.13 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4366  manganese transporter NRAMP  26.04 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4453  Mn2+/Fe2+ transporter  26.04 
 
 		 408 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.0620923 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  24.22 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4747  Mn2+/Fe2+ transporter  26.04 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  21.98 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  22.17 
 
 		 453 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  24.88 
 
 		 439 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4410  natural resistance-associated macrophage protein  23.42 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2183  manganese transporter NRAMP  24.58 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0049052  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  23.87 
 
 		 463 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1822  Mn2+/Fe2+ transporter  25.97 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  23.6 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2958  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.91 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1197  natural resistance-associated macrophage protein  25.43 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  23.68 
 
 		 462 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5209  putative Mn2+/Fe2+ transporter protein  23.16 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112749  normal  0.693685 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1353  natural resistance-associated macrophage protein  23.95 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.573768  normal  0.0815096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3159  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.71 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.495949  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  24.14 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  28.1 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.17 
 
 		 439 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4542  manganese transport protein MntH  25.96 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.565982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.7 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0999  NRAMP family Mn2+ and Fe2+ transporter  24.57 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  25.56 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2687  manganese transport protein MntH  24.22 
 
 		 452 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  24.08 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.06 
 
 		 450 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  23.17 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  23.88 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  22.98 
 
 		 426 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  22.86 
 
 		 448 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  24.2 
 
 		 441 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  23.4 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00399  manganese transport protein MntH  26.04 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.192787  normal  0.707111 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>