247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1197 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1197  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
376 aa  717    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0439  natural resistance-associated macrophage protein  49.06 
 
 
371 aa  300  3e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0333  natural resistance-associated macrophage protein  55.39 
 
 
373 aa  286  4e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.504032  normal  0.012929 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  32.07 
 
 
434 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  33.69 
 
 
425 aa  167  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  34.38 
 
 
434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  32.7 
 
 
432 aa  162  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  36.41 
 
 
439 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2759  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  34.17 
 
 
430 aa  159  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  34.82 
 
 
433 aa  159  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1154  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  35.95 
 
 
420 aa  159  9e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110246  hitchhiker  0.00000690908 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  34.86 
 
 
411 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  33.7 
 
 
432 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  34.85 
 
 
429 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  33.88 
 
 
439 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  32.23 
 
 
414 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  33.43 
 
 
442 aa  152  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1618  Mn2+/Fe2+ transporter  35.8 
 
 
442 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  34.54 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  32.79 
 
 
436 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  32.79 
 
 
436 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  32.79 
 
 
436 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  31.38 
 
 
448 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  32.76 
 
 
441 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  34.5 
 
 
432 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  36.8 
 
 
413 aa  145  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  32.48 
 
 
438 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  31.85 
 
 
431 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  30.06 
 
 
423 aa  144  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  33.07 
 
 
431 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  32.64 
 
 
431 aa  143  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  32.64 
 
 
431 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1425  manganese/iron transporter  33.43 
 
 
449 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  33.07 
 
 
431 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4171  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  31.73 
 
 
433 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248736  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  32.01 
 
 
460 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  32.77 
 
 
447 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2576  manganese/iron transporter  33.99 
 
 
449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.202281  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  32.01 
 
 
462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  33.52 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1332  manganese/iron transporter  33.99 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  30.06 
 
 
409 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  30.06 
 
 
409 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1414  manganese/iron transporter  33.99 
 
 
437 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  29.77 
 
 
412 aa  139  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  29.77 
 
 
412 aa  139  7e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1258  manganese/iron transporter  34.19 
 
 
431 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1815  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  30.14 
 
 
409 aa  139  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0230  manganese/iron transporter  34.19 
 
 
437 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0502  manganese/iron transporter  34.19 
 
 
437 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  32.87 
 
 
445 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1068  manganese/iron transporter  34.19 
 
 
437 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.028316  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3704  manganese transport protein MntH  31.93 
 
 
438 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.33277 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  30.89 
 
 
435 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  29.69 
 
 
437 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  29.69 
 
 
437 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  29.69 
 
 
437 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  29.69 
 
 
437 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0222  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  33.42 
 
 
439 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  29.23 
 
 
413 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  30.62 
 
 
438 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  28.32 
 
 
412 aa  136  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  29.31 
 
 
392 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  29.31 
 
 
392 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  29.69 
 
 
437 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  29.31 
 
 
392 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  29.31 
 
 
392 aa  135  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2981  manganese transport protein MntH  30.88 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148105  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  33.99 
 
 
463 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1822  Mn2+/Fe2+ transporter  34.93 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  28.9 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  31.09 
 
 
438 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3722  manganese transport protein MntH  31.09 
 
 
438 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.143868  normal  0.171771 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1050  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  32.79 
 
 
441 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3802  manganese transport protein MntH  31.09 
 
 
438 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  28.94 
 
 
412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.94 
 
 
412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  28.94 
 
 
412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1718  manganese transport protein MntH  33.07 
 
 
431 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  28.94 
 
 
412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  28.94 
 
 
412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  28.94 
 
 
412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  28.94 
 
 
412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  28.94 
 
 
412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  28.94 
 
 
412 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  33.07 
 
 
431 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  33.07 
 
 
431 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  33.07 
 
 
431 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4366  manganese transporter NRAMP  34.14 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4453  Mn2+/Fe2+ transporter  34.14 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.0620923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4747  Mn2+/Fe2+ transporter  34.14 
 
 
408 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2071  manganese transport protein MntH  31.67 
 
 
445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  32.32 
 
 
431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56340  manganese transport protein MntH  33.33 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  30.36 
 
 
627 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  30.14 
 
 
429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5528  manganese transport protein MntH  31.79 
 
 
391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.30234  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  28.67 
 
 
414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2305  manganese transport protein MntH  31.11 
 
 
439 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.423975  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  32.63 
 
 
431 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>