156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2571 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  100 
 
 
415 aa  818    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  57.07 
 
 
429 aa  464  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  57.38 
 
 
433 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  53.19 
 
 
446 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  53.1 
 
 
427 aa  386  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  27.16 
 
 
433 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.62 
 
 
434 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  26.92 
 
 
435 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3546  manganese transporter NRAMP  29.98 
 
 
453 aa  124  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0787063  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  26.75 
 
 
419 aa  103  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  25.6 
 
 
412 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  27.16 
 
 
401 aa  97.8  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  24.58 
 
 
397 aa  90.9  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  24.65 
 
 
406 aa  89  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2881  manganese transporter NRAMP  24.76 
 
 
468 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0516057  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  24.82 
 
 
403 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  24.56 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  26.55 
 
 
408 aa  84  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4143  Mn2+ and Fe2+ transporters of the NRAMP family- like protein  24.94 
 
 
440 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  24.65 
 
 
416 aa  80.1  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3404  hypothetical protein  21.76 
 
 
508 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  22.55 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  24.41 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  22.31 
 
 
401 aa  73.6  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.94 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  21.6 
 
 
414 aa  70.1  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  24.47 
 
 
418 aa  70.1  0.00000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0835  putative manganese transporter  24.04 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  22.64 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3643  natural resistance-associated macrophage protein  25.31 
 
 
412 aa  67.4  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.145249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  20.99 
 
 
404 aa  67  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2965  putative manganese transporter  25.23 
 
 
422 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1463  manganese transport protein MntH  22.99 
 
 
432 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0201328  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0498  hypothetical protein  24.32 
 
 
413 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.397135  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3470  manganese transport protein MntH  22.7 
 
 
431 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00427839  hitchhiker  0.000000000922874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1988  manganese transport protein MntH  22.34 
 
 
431 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.40777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3755  putative manganese transporter  26.26 
 
 
424 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.533045  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  22.3 
 
 
431 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1874  manganese transport protein MntH  22.34 
 
 
431 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.558588  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2183  manganese transporter NRAMP  26.61 
 
 
326 aa  64.7  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0049052  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3515  putative manganese transporter  22.85 
 
 
425 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  22.93 
 
 
431 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  22.49 
 
 
398 aa  63.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0572  hypothetical protein  23.38 
 
 
421 aa  63.2  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3186  putative manganese transporter  24.22 
 
 
428 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645934 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0786  putative manganese transporter  25.08 
 
 
424 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1353  natural resistance-associated macrophage protein  26.21 
 
 
455 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.573768  normal  0.0815096 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0678  putative manganese transporter  25.93 
 
 
424 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194711  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3564  putative manganese transporter  25.93 
 
 
424 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0237  Mn2+/Fe2+ transporter  22.82 
 
 
437 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0400358  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09041  hypothetical protein  22.82 
 
 
437 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000283446 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  23.17 
 
 
417 aa  60.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3632  putative manganese transporter  25.59 
 
 
424 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162179  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0780  putative manganese transporter  24.29 
 
 
428 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0288691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03675  hypothetical protein  23.53 
 
 
421 aa  60.5  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1743  manganese transport protein MntH  22.83 
 
 
431 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1880  manganese transport protein MntH  22.83 
 
 
431 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0752  putative manganese transporter  24.52 
 
 
428 aa  59.7  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0350647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4676  transporter  24.18 
 
 
422 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1669  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 
659 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3895  hitchhiker  0.0000000000177402 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11901  manganese transporter NRAMP  22.25 
 
 
435 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.328573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  21.24 
 
 
427 aa  59.3  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1693  manganese transport protein MntH  22.46 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1915  manganese transport protein MntH  22.46 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000228636 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  23.24 
 
 
450 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  23.24 
 
 
450 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5209  putative Mn2+/Fe2+ transporter protein  23.66 
 
 
406 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112749  normal  0.693685 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  23.13 
 
 
425 aa  57.4  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12521  hypothetical protein  20.44 
 
 
436 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.458763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0905  putative manganese transporter  22.01 
 
 
424 aa  57  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1807  natural resistance-associated macrophage protein  23.03 
 
 
401 aa  56.6  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0530  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family-like protein  23.55 
 
 
442 aa  56.6  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5809  putative manganese transport protein  24.24 
 
 
434 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.354355  normal  0.770207 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2933  natural resistance-associated macrophage protein  25.06 
 
 
453 aa  56.2  0.0000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1718  manganese transport protein MntH  22.1 
 
 
431 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0694  hypothetical protein  23.04 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.173861  normal  0.146258 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0852  Mn2+ and Fe2+ transporter of the NRAMP family- like protein  26.67 
 
 
413 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0786  manganese transporter NRAMP  23.89 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000167899  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  22.73 
 
 
453 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  24.63 
 
 
431 aa  54.3  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  23.53 
 
 
437 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  23.53 
 
 
437 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2657  manganese transport protein MntH  23.79 
 
 
460 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.290944  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  23.53 
 
 
437 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  23.53 
 
 
437 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  23.53 
 
 
437 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  21.93 
 
 
441 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2648  manganese transport protein MntH  23.88 
 
 
462 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.860814 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1219  Mn2+/Fe2+ transporter  22 
 
 
434 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.54057  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  22.68 
 
 
429 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  24.37 
 
 
408 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  21.94 
 
 
429 aa  50.8  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  23.96 
 
 
452 aa  50.4  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0222  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  23.3 
 
 
439 aa  50.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  23.99 
 
 
463 aa  50.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002393  hypothetical protein  21.38 
 
 
396 aa  49.7  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4561  manganese transport protein MntH  24.13 
 
 
438 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2395  natural resistance-associated macrophage protein  24.75 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1822  Mn2+/Fe2+ transporter  22.17 
 
 
407 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  22.08 
 
 
622 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>