285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1064 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1064  natural resistance-associated macrophage protein  100 
 
 
430 aa  805    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.262705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0733  natural resistance-associated macrophage protein  46.43 
 
 
422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  37.13 
 
 
412 aa  242  9e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  39.85 
 
 
401 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  36.8 
 
 
403 aa  216  7e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  42.17 
 
 
419 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  39.11 
 
 
406 aa  212  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  39.34 
 
 
398 aa  209  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  37.37 
 
 
397 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  37.8 
 
 
416 aa  199  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  38.04 
 
 
408 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  38.77 
 
 
415 aa  189  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  27 
 
 
404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  26.5 
 
 
427 aa  106  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  27.15 
 
 
432 aa  106  9e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  25.68 
 
 
414 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4401  Mn2+/Fe2+ transporter  32.13 
 
 
439 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.412644  normal  0.493803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  28.31 
 
 
432 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  27.34 
 
 
408 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0932  Mn2+/Fe2+ transporter  31.13 
 
 
622 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  32.24 
 
 
439 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  26.87 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  28.11 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  25.71 
 
 
415 aa  97.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  27.04 
 
 
425 aa  95.9  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  25.78 
 
 
432 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  27.81 
 
 
439 aa  93.2  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27409  Nramp family transporter: metal ion  28.98 
 
 
489 aa  91.7  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.112546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1439  manganese transport protein MntH  27.05 
 
 
409 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.766708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1327  manganese transport protein MntH  27.05 
 
 
409 aa  90.9  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0143258  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  31.87 
 
 
445 aa  90.1  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5787  Mn2+/Fe2+ transporter  33.01 
 
 
456 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.521551  hitchhiker  0.00775993 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  30.56 
 
 
432 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  30.1 
 
 
434 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  25.13 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.13 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  25.13 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  25.13 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  27.79 
 
 
452 aa  88.6  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2760  manganese transport protein MntH  25.13 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  25.13 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02301  manganese transport protein MntH  25.13 
 
 
412 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2529  manganese transport protein MntH  25.13 
 
 
412 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02262  hypothetical protein  25.13 
 
 
412 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  26.98 
 
 
414 aa  87  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  26.25 
 
 
428 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1425  manganese/iron transporter  32.03 
 
 
449 aa  86.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  27.62 
 
 
412 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  27.62 
 
 
412 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  30.18 
 
 
432 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3092  Mn2+/Fe2+ transporter  29.78 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.612928  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10942  manganese transport protein MntH  27.22 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1068  manganese/iron transporter  32.45 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.028316  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1258  manganese/iron transporter  32.45 
 
 
431 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1414  manganese/iron transporter  32.03 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.104152  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  27.37 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  27.62 
 
 
411 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0230  manganese/iron transporter  32.45 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0502  manganese/iron transporter  32.45 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  23.28 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1332  manganese/iron transporter  32.34 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  28.2 
 
 
441 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6585  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  31.62 
 
 
625 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  24.45 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  24.66 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2576  manganese/iron transporter  32.34 
 
 
449 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.202281  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  24.31 
 
 
392 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  24.31 
 
 
392 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  24.31 
 
 
392 aa  84  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0860  manganese transport protein MntH  26.81 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1781  manganese transport protein MntH  26.81 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.298832  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0665  manganese transport protein MntH  26.81 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.465799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3215  manganese transport protein MntH  26.35 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00440614  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1384  manganese transport protein MntH  26.81 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0492  manganese transport protein MntH  26.81 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0858  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  31.7 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.929447  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5209  putative Mn2+/Fe2+ transporter protein  26.84 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112749  normal  0.693685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0230  manganese transport protein MntH  27.76 
 
 
426 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925481  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3415  manganese transport protein MntH  26.35 
 
 
410 aa  82.8  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.406737  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  25.47 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0955  manganese transport protein  27.57 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1553  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  30.09 
 
 
627 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.656007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4658  manganese transport protein MntH  29.3 
 
 
447 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4677  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  28.43 
 
 
450 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  23.44 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2926  manganese transport protein MntH  25.07 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.382468  normal  0.128349 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1584  manganese transport protein  28.5 
 
 
453 aa  80.1  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.984179  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1397  manganese transport protein MntH  25.56 
 
 
429 aa  79.7  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.665917  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  27.75 
 
 
438 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0570  manganese transport protein MntH  29.32 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  26.33 
 
 
448 aa  78.2  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0692  manganese transport protein MntH  25.85 
 
 
453 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  27.57 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  27.57 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1687  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  31.51 
 
 
448 aa  78.2  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.26343 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  27.57 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1822  Mn2+/Fe2+ transporter  28.5 
 
 
407 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.948039  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4120  manganese transport protein MntH  27.83 
 
 
448 aa  77  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.987586  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2294  manganese transport protein MntH  28.25 
 
 
438 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  26.82 
 
 
441 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>